BLASTN 2.0MP-WashU [26-Mar-2005] [linux26-i686-ILP32F64 2005-03-26T23:28:52]
Copyright (C) 1996-2005 Washington University, Saint Louis, Missouri USA.
All Rights Reserved.
Reference: Gish, W. (1996-2005) http://blast.wustl.edu
Notice: this program and its default parameter settings are optimized to find
nearly identical sequences rapidly. To identify weak protein similarities
encoded in nucleic acid, use BLASTX, TBLASTN or TBLASTX.
Query= Contig8
(5,331,656 letters)
WARNING: Use of the hspsepQmax parameter should be considered with long query
sequences, to improve the biological relevance of the HSP groups
that are assembled and to improve the statistical discrimination of
these groups from random background.
Database: 16S.fasta
12,250 sequences; 17,852,017 total letters.
Searching....10....20....30....40....50....60....70....80....90....100% done
Smallest
Sum
High Probability
Sequences producing High-scoring Segment Pairs: Score P(N) N
Rhodopseudomonas palustris L11664 (length=1464) 7246 2.2e-318 1
Afipia genosp. U87766 (length=1488) 7234 7.1e-318 1
Bradyrhizobium japonicum U69638 (length=1489) 7177 2.7e-315 1
Rhodopseudomonas palustris AF184625 (length=1489) 7168 6.8e-315 1
Rhodopseudomonas palustris AF184626 (length=1489) 7168 6.8e-315 1
Afipia genosp. U87769 (length=1461) 7153 3.3e-314 1
Rhodopseudomonas palustris D89811 (length=1481) 7128 4.4e-313 1
Bradyrhizobium lupini X87273 (length=1484) 7119 1.1e-312 1
Rhodopseudomonas palustris D84187 (length=1481) 7110 2.8e-312 1
Afipia genosp. U87768 (length=1453) 7101 7.4e-312 1
WARNING: Descriptions of 12,238 database sequences were not reported due to
the limiting value of parameter V = 10.
>Rhodopseudomonas palustris L11664 (length=1464)
Length = 1464
Minus Strand HSPs:
Score = 7246 (1093.2 bits), Expect = 2.2e-318, P = 2.2e-318
Identities = 1458/1466 (99%), Positives = 1458/1466 (99%), Strand = Minus / Plus
Query: 4825909 GATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAACGGGCATA 4825850
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 1 GATCTTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACAC-TGCAAGTCGAACGGGCATA 59
Query: 4825849 GCAATATGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGGAACGTACCTTTTGGTTCGGAAC 4825790
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 60 GCAATATGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTACCTTTTGGTTCGGAAC 119
Query: 4825789 AACTGAGGGAAACTTCAGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTATCGCCGA 4825730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 120 AACTGAGGGAAACTTCAGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTATCGCCGA 179
Query: 4825729 AAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCGACGATC 4825670
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct: 180 AAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGTGGTAAAGGCGCACCAAGGCGACGATC 239
Query: 4825669 AGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTA 4825610
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 240 AGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTGCTA 299
Query: 4825609 CGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCG 4825550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 300 CGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCG 359
Query: 4825549 TGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGACGGTACC 4825490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 360 TGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGACGGTACC 419
Query: 4825489 GCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGC 4825430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 420 GCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGC 479
Query: 4825429 GTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGAGGTGAAA 4825370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 GTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGAGGTGAAA 539
Query: 4825369 GCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTATGGGAGAGGTG 4825310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 540 GCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTATGGGAGAGGTG 599
Query: 4825309 AGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCGAA 4825250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 AGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCGAA 659
Query: 4825249 GGCGGCTCACTGGCCCATAACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATT 4825190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660 GGCGGCTCACTGGCCCATAACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATT 719
Query: 4825189 AGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGTTTACTCAC 4825130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 AGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGTTTACTCAC 779
Query: 4825129 TAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAAC 4825070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 TAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAAC 839
Query: 4825069 TCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCAAC 4825010
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840 TCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCAAC 899
Query: 4825009 GCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAGAGATGTGACCTTCTC 4824950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 900 GCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAGAGATGTGACCTTCTC 959
Query: 4824949 TTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGG 4824890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 960 TTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGG 1019
Query: 4824889 GTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTGAGCACTC 4824830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1020 GTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTGAGCACTC 1079
Query: 4824829 TAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGC 4824770
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1080 TAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGC 1139
Query: 4824769 CCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGATGCTAAGGGGCG 4824710
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1140 CCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGATGCTAAGGGGCG 1199
Query: 4824709 ACCCTTCGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCA 4824650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1200 ACCCTTCGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCA 1259
Query: 4824649 TGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCC 4824590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1260 TGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCC 1319
Query: 4824589 TTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCTGAAGGCAGTGCGCTAACC 4824530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1320 TTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCTGAAGGCAGTGCGCTAACC 1379
Query: 4824529 CGCAAGGGAGGCAGCTGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA 4824470
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1380 CGCAAGG-AGGCAGCTGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA 1438
Query: 4824469 GCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATC 4824444
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1439 GCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATC 1464
>Afipia genosp. U87766 (length=1488)
Length = 1488
Minus Strand HSPs:
Score = 7234 (1091.4 bits), Expect = 7.1e-318, P = 7.1e-318
Identities = 1464/1484 (98%), Positives = 1464/1484 (98%), Strand = Minus / Plus
Query: 4825919 TTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCG 4825860
|| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 2 TTAAGAGTT-GATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATCCAAGTCG 60
Query: 4825859 AACGGGCATAGCAATATGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGGAACGTACCTTTT 4825800
||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 AACGGGCGTAGCAATACGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGGAACGTACCTTTT 120
Query: 4825799 GGTTCGGAACAACTGAGGGAAACTTCAGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGAT 4825740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 GGTTCGGAACAACTGAGGGAAACTTCAGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGAT 180
Query: 4825739 TTATCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAA 4825680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 TTATCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAA 240
Query: 4825679 GGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCC 4825620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 GGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCC 300
Query: 4825619 CAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAG 4825560
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 301 CAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAG 360
Query: 4825559 CCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAA 4825500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 CCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAA 420
Query: 4825499 TGACGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAA 4825440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 TGACGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAA 480
Query: 4825439 GGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTC 4825380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 GGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTC 540
Query: 4825379 AGAGGTGAAAGCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTAT 4825320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 AGAGGTGAAAGCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTAT 600
Query: 4825319 GGGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACAC 4825260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 GGGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACAC 660
Query: 4825259 CAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCATAACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGC 4825200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 CAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCATAACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGC 720
Query: 4825199 AAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGG 4825140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 AAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGG 780
Query: 4825139 GTTTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCA 4825080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 GTTTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCA 840
Query: 4825079 AGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAAT 4825020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 AGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAAT 900
Query: 4825019 TCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAGAGATG 4824960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 TCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAGAGATG 960
Query: 4824959 TGACCTTCTCTTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGT 4824900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 TGACCTTCTCTTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGT 1020
Query: 4824899 GAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAG 4824840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 GAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAG 1080
Query: 4824839 TTGAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAG 4824780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 TTGAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAG 1140
Query: 4824779 TCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGATG 4824720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 TCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGATG 1200
Query: 4824719 CTAAGGGGCGACCCTTCGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGAGTCTGCAA 4824660
|||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 1201 CTAAGGGGCGACCCCTCGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAA 1260
Query: 4824659 CTCGACTCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACG 4824600
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 CTCGAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACG 1320
Query: 4824599 TTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCTGAAGGCAG 4824540
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |
Sbjct: 1321 TTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGCTTTACCTGAAGACGG 1380
Query: 4824539 TGCGCTAACCCGCAAGGGAGGCAGCTGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCG 4824480
|||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 TGCGCTAACCAGCAATGGAGGCAGCCGGCCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCG 1440
Query: 4824479 TAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTT 4824436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 TAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTT 1484
>Bradyrhizobium japonicum U69638 (length=1489)
Length = 1489
Minus Strand HSPs:
Score = 7177 (1082.9 bits), Expect = 2.7e-315, P = 2.7e-315
Identities = 1461/1490 (98%), Positives = 1461/1490 (98%), Strand = Minus / Plus
Query: 4825915 GAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAACG 4825856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 1 GAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAGCG 60
Query: 4825855 GGCATAGCAATATGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGGAACGTACCTTTTGGTT 4825796
||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 GGCGTAGCAATACGTCAGCGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTACCTTTTGGTT 120
Query: 4825795 CGGAACAACTGAGGGAAACTTCAGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTAT 4825736
||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 CGGAACAACACAGGGAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTAT 180
Query: 4825735 CGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCG 4825676
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 CGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCG 240
Query: 4825675 ACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAA 4825616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAA 300
Query: 4825615 CTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCCAT 4825556
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||
Sbjct: 301 CTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGGGCAACCCTGATCCAGCCAT 360
Query: 4825555 GCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGAC 4825496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 GCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGAC 420
Query: 4825495 GGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGG 4825436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 GGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGG 480
Query: 4825435 GCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGAG 4825376
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 481 GCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGGG 540
Query: 4825375 GTGAAAGCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTATGGGA 4825316
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 541 GTGAAATCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTTCGGGA 600
Query: 4825315 GAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGT 4825256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 GAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGT 660
Query: 4825255 GGCGAAGGCGGCTCACTGGCCC-ATAACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAA 4825197
|||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 GGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCGATA-CTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAA 719
Query: 4825196 CAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGTT 4825137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 CAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGTT 779
Query: 4825136 TACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGA 4825077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 TACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGA 839
Query: 4825076 TTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCG 4825017
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840 TTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCG 899
Query: 4825016 ACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAGAGATGTGA 4824957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 900 ACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAGAGATGTGA 959
Query: 4824956 CCTTCTCTTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAG 4824897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 960 CCTTCTCTTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAG 1019
Query: 4824896 ATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTG 4824837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1020 ATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTG 1079
Query: 4824836 AGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCC 4824777
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1080 AGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCC 1139
Query: 4824776 TCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGATGCTA 4824717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1140 TCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGATGCTA 1199
Query: 4824716 AGGGGCGACCCTTCGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGAGTCTGCAACTC 4824657
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 1200 AGGGGCGACCCTTCGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAACTC 1259
Query: 4824656 GACTCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTC 4824597
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 1260 GAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCACGCCACGGTGAATACGTTC 1319
Query: 4824596 CCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCTGAAGGCAGTGC 4824537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||
Sbjct: 1320 CCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTGAAGACGGTGC 1379
Query: 4824536 GCTAACCCGCAAGGGAGGCAGCTGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAA 4824477
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1380 GCTAACCCGCAAGGGAGGCAGCCGGCCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAA 1439
Query: 4824476 CAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGAT 4824427
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1440 CAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGAT 1489
>Rhodopseudomonas palustris AF184625 (length=1489)
Length = 1489
Minus Strand HSPs:
Score = 7168 (1081.5 bits), Expect = 6.8e-315, P = 6.8e-315
Identities = 1460/1490 (97%), Positives = 1460/1490 (97%), Strand = Minus / Plus
Query: 4825925 TCCAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGC 4825866
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 TCCAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGC 60
Query: 4825865 AAGTCGAACGGGCATAGCAATATGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGGAACGTA 4825806
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 61 AAGTCGAACGGGCGTAGCAATACGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTA 120
Query: 4825805 CCTTTTGGTTCGGAACAACTGAGGGAAACTTCAGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGG 4825746
||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 CCTTTTGGTTCGGAACAACACAGGGAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGG 180
Query: 4825745 AAAGATTTATCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCT 4825686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 AAAGATTTATCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCT 240
Query: 4825685 CACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGAC 4825626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 CACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGAC 300
Query: 4825625 ACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTG 4825566
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTG 360
Query: 4825565 ATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGA 4825506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGA 420
Query: 4825505 AGATAATGACGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAA 4825446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 AGATAATGACGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAA 480
Query: 4825445 TACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTT 4825386
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 481 TACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTTTC 540
Query: 4825385 TAAGTCAGAGGTGAAAGCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGA-TCT 4825327
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||
Sbjct: 541 TAAGTCAGAGGTGAAAGCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTG-GAAGTCT 599
Query: 4825326 TGAGTATGGGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCA 4825267
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 TGAGTATGGCAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCA 659
Query: 4825266 AGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCATAACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGT 4825207
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660 AGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGGCCATTACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGT 719
Query: 4825206 GGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCG 4825147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 GGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCG 779
Query: 4825146 TTAGTGGGTTTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTAC 4825087
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 TTAGTGGGTTTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTAC 839
Query: 4825086 GGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTG 4825027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840 GGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTG 899
Query: 4825026 GTTTAATTCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGC 4824967
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 900 GTTTAATTCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGC 959
Query: 4824966 AGAGATGTGACCTTCTCTTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTC 4824907
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 960 AGAGACGTGACCTTCTCTTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTC 1019
Query: 4824906 GTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTAC 4824847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1020 GTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTAC 1079
Query: 4824846 CATTTAGTTGAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGA 4824787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1080 CATTTAGTTGAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGA 1139
Query: 4824786 CGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAA 4824727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1140 CGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAA 1199
Query: 4824726 TGGGATGCTAAGGGGCGACCCTTCGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGAG 4824667
||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 1200 TGGGAAGCTAAGGGGTGACCCTTCGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGGC 1259
Query: 4824666 TCTGCAACTCGACTCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGT 4824607
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1260 TCTGCAACTCGAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGT 1319
Query: 4824606 GAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCTG 4824547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct: 1320 GAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGCTTTACCTG 1379
Query: 4824546 AAGGCAGTGCGCTAACCCGCAAGGGAGGCAGCTGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGT 4824487
||| | ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1380 AAGACGGTGCGCTAACCCGCAAGGGGGGCAGCCGGCCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGT 1439
Query: 4824486 GAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCT 4824437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1440 GAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCT 1489
>Rhodopseudomonas palustris AF184626 (length=1489)
Length = 1489
Minus Strand HSPs:
Score = 7168 (1081.5 bits), Expect = 6.8e-315, P = 6.8e-315
Identities = 1460/1490 (97%), Positives = 1460/1490 (97%), Strand = Minus / Plus
Query: 4825925 TCCAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGC 4825866
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 TCCAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGC 60
Query: 4825865 AAGTCGAACGGGCATAGCAATATGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGGAACGTA 4825806
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 61 AAGTCGAACGGGCGTAGCAATACGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTA 120
Query: 4825805 CCTTTTGGTTCGGAACAACTGAGGGAAACTTCAGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGG 4825746
||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 CCTTTTGGTTCGGAACAACACAGGGAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGG 180
Query: 4825745 AAAGATTTATCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCT 4825686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 AAAGATTTATCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCT 240
Query: 4825685 CACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGAC 4825626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 CACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGAC 300
Query: 4825625 ACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTG 4825566
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTG 360
Query: 4825565 ATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGA 4825506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGA 420
Query: 4825505 AGATAATGACGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAA 4825446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 AGATAATGACGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAA 480
Query: 4825445 TACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTT 4825386
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 481 TACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTTTC 540
Query: 4825385 TAAGTCAGAGGTGAAAGCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGA-TCT 4825327
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||
Sbjct: 541 TAAGTCAGAGGTGAAAGCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTG-GAAGTCT 599
Query: 4825326 TGAGTATGGGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCA 4825267
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 TGAGTATGGCAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCA 659
Query: 4825266 AGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCATAACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGT 4825207
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660 AGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGGCCATTACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGT 719
Query: 4825206 GGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCG 4825147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 GGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCG 779
Query: 4825146 TTAGTGGGTTTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTAC 4825087
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 TTAGTGGGTTTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTAC 839
Query: 4825086 GGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTG 4825027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840 GGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTG 899
Query: 4825026 GTTTAATTCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGC 4824967
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 900 GTTTAATTCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGC 959
Query: 4824966 AGAGATGTGACCTTCTCTTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTC 4824907
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 960 AGAGACGTGACCTTCTCTTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTC 1019
Query: 4824906 GTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTAC 4824847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1020 GTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTAC 1079
Query: 4824846 CATTTAGTTGAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGA 4824787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1080 CATTTAGTTGAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGA 1139
Query: 4824786 CGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAA 4824727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1140 CGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAA 1199
Query: 4824726 TGGGATGCTAAGGGGCGACCCTTCGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGAG 4824667
||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 1200 TGGGAAGCTAAGGGGTGACCCTTCGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGGC 1259
Query: 4824666 TCTGCAACTCGACTCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGT 4824607
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1260 TCTGCAACTCGAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGT 1319
Query: 4824606 GAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCTG 4824547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct: 1320 GAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGCTTTACCTG 1379
Query: 4824546 AAGGCAGTGCGCTAACCCGCAAGGGAGGCAGCTGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGT 4824487
||| | ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1380 AAGACGGTGCGCTAACCCGCAAGGGGGGCAGCCGGCCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGT 1439
Query: 4824486 GAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCT 4824437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1440 GAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCT 1489
>Afipia genosp. U87769 (length=1461)
Length = 1461
Minus Strand HSPs:
Score = 7153 (1079.3 bits), Expect = 3.3e-314, P = 3.3e-314
Identities = 1445/1460 (98%), Positives = 1445/1460 (98%), Strand = Minus / Plus
Query: 4825916 AGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAAC 4825857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 AGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAAC 61
Query: 4825856 GGGCATAGCAATATGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGGAACGTACCTTTTGGT 4825797
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 GGGCGTAGCAATACGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGGAACGTACCTTTTGGT 121
Query: 4825796 TCGGAACAACTGAGGGAAACTTCAGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTA 4825737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 TCGGAACAACTGAGGGAAACTTCAGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTA 181
Query: 4825736 TCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGC 4825677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 TCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGC 241
Query: 4825676 GACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAA 4825617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 GACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAA 301
Query: 4825616 ACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCCA 4825557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 ACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCCA 361
Query: 4825556 TGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGA 4825497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 TGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGA 421
Query: 4825496 CGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGG 4825437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 CGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGG 481
Query: 4825436 GGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGA 4825377
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 GGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGA 541
Query: 4825376 GGTGAAAGCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTATGGG 4825317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 GGTGAAAGCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTATGGG 601
Query: 4825316 AGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAG 4825257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 AGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAG 661
Query: 4825256 TGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCATAACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAA 4825197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 TGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCATAACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAA 721
Query: 4825196 CAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGTT 4825137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722 CAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGTT 781
Query: 4825136 TACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGA 4825077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 782 TACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGA 841
Query: 4825076 TTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCG 4825017
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 842 TTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCG 901
Query: 4825016 ACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAGAGATGTGA 4824957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 902 ACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAGAGATGTGA 961
Query: 4824956 CCTTCTCTTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAG 4824897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 962 CCTTCTCTTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAG 1021
Query: 4824896 ATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTG 4824837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1022 ATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTG 1081
Query: 4824836 AGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCC 4824777
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1082 AGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCC 1141
Query: 4824776 TCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGATGCTA 4824717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1142 TCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGATGCTA 1201
Query: 4824716 AGGGGCGACCCTTCGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGAGTCTGCAACTC 4824657
||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 1202 AGGGGCGACCCCTCGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAACTC 1261
Query: 4824656 GACTCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTC 4824597
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1262 GAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTC 1321
Query: 4824596 CCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCTGAAGGCAGTGC 4824537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||
Sbjct: 1322 CCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTGAAGACGGTGC 1381
Query: 4824536 GCTAACCCGCAAGGGAGGCAGCTGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAA 4824477
||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1382 GCTAACC-GCAAGG-AGGCAGCCGGCCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAA 1439
Query: 4824476 CAAGGTAGCCGTAGGGGAAC 4824457
||||||||||||||||||||
Sbjct: 1440 CAAGGTAGCCGTAGGGGAAC 1459
>Rhodopseudomonas palustris D89811 (length=1481)
Length = 1481
Minus Strand HSPs:
Score = 7128 (1075.5 bits), Expect = 4.4e-313, P = 4.4e-313
Identities = 1452/1482 (97%), Positives = 1452/1482 (97%), Strand = Minus / Plus
Query: 4825916 AGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAAC 4825857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 AGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAAC 60
Query: 4825856 GGGCATAGCAATATGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGGAACGTACCTTTTGGT 4825797
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 GGGCGTAGCAATACGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTACCTTTTGGT 120
Query: 4825796 TCGGAACAACTGAGGGAAACTTCAGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTA 4825737
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 TCGGAACAACACAGGGAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTA 180
Query: 4825736 TCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGC 4825677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 TCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGC 240
Query: 4825676 GACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAA 4825617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 GACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAA 300
Query: 4825616 ACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCCA 4825557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCCA 360
Query: 4825556 TGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGA 4825497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 TGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGA 420
Query: 4825496 CGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGG 4825437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 CGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGG 480
Query: 4825436 GGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGA 4825377
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct: 481 GGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTTTCTAAGTCAGA 540
Query: 4825376 GGTGAAAGCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGA-TCTTGAGTATGG 4825318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||
Sbjct: 541 GGTGAAAGCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTG-GAAGTCTTGAGTATGG 599
Query: 4825317 GAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCA 4825258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 CAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCA 659
Query: 4825257 GTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCATAACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAA 4825198
||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660 GTGGCGAAGGCGGCTCACTGGGCCATTACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAA 719
Query: 4825197 ACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGT 4825138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 ACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGT 779
Query: 4825137 TTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAG 4825078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 TTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAG 839
Query: 4825077 ATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTC 4825018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840 ATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTC 899
Query: 4825017 GACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAGAGATGTG 4824958
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 900 GACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAGAGACGTG 959
Query: 4824957 ACCTTCTCTTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGA 4824898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 960 ACCTTCTCTTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGA 1019
Query: 4824897 GATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTT 4824838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1020 GATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTT 1079
Query: 4824837 GAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTC 4824778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1080 GAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTC 1139
Query: 4824777 CTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGATGCT 4824718
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 1140 CTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGAAGCT 1199
Query: 4824717 AAGGGGCGACCCTTCGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGAGTCTGCAACT 4824658
|||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 1200 AAGGGGTGACCCTTCGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAACT 1259
Query: 4824657 CGACTCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTT 4824598
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1260 CGAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTT 1319
Query: 4824597 CCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCTGAAGGCAGTG 4824538
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||
Sbjct: 1320 CCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGCTTTACCTGAAGACGGTG 1379
Query: 4824537 CGCTAACCCGCAAGGGAGGCAGCTGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTA 4824478
|||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1380 CGCTAACCCGCAAGGGGGGCAGCCGGCCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTA 1439
Query: 4824477 ACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTT 4824436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1440 ACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTT 1481
>Bradyrhizobium lupini X87273 (length=1484)
Length = 1484
Minus Strand HSPs:
Score = 7119 (1074.2 bits), Expect = 1.1e-312, P = 1.1e-312
Identities = 1451/1483 (97%), Positives = 1451/1483 (97%), Strand = Minus / Plus
Query: 4825916 AGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAAC 4825857
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 1 AGAGTTTGATNNTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAGC 60
Query: 4825856 GGGCATAGCAATATGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGGAACGTACCTTTTGGT 4825797
|||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 GGGCGTAGCAATACGTCAGCGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTACCTTTTGGT 120
Query: 4825796 TCGGAACAACTGAGGGAAACTTCAGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTA 4825737
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 TCGGAACAACACAGGGAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTA 180
Query: 4825736 TCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGC 4825677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 TCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGC 240
Query: 4825676 GACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAA 4825617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 GACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAA 300
Query: 4825616 ACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCCA 4825557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||
Sbjct: 301 ACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGGGCAACCCTGATCCAGCCA 360
Query: 4825556 TGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGA 4825497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 TGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGA 420
Query: 4825496 CGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGG 4825437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 CGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGG 480
Query: 4825436 GGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGA 4825377
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 GGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGG 540
Query: 4825376 GGTGAAAGCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTATGGG 4825317
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 541 GGTGAAATCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTTCGGG 600
Query: 4825316 AGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAG 4825257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 AGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAG 660
Query: 4825256 TGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCC-ATAACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAA 4825198
||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 TGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCGATA-CTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAA 719
Query: 4825197 ACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGT 4825138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 ACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGT 779
Query: 4825137 TTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAG 4825078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 TTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAG 839
Query: 4825077 ATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTC 4825018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840 ATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTC 899
Query: 4825017 GACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAGAGATGTG 4824958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 900 GACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAGAGATGTG 959
Query: 4824957 ACCTTCTCTTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGA 4824898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 960 ACCTTCTCTTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGA 1019
Query: 4824897 GATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTT 4824838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1020 GATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTT 1079
Query: 4824837 GAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTC 4824778
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1080 GAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTCATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTC 1139
Query: 4824777 CTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGATGCT 4824718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1140 CTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGATGCT 1199
Query: 4824717 AAGGGGCGACCCTTCGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGAGTCTGCAACT 4824658
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 1200 AAGGGGCGACCCTTCGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAACT 1259
Query: 4824657 CGACTCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTT 4824598
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 1260 CGAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCACGCCACGGTGAATACGTT 1319
Query: 4824597 CCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCTGAAGGCAGTG 4824538
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||
Sbjct: 1320 CCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTGAAGACGGTG 1379
Query: 4824537 CGCTAACCCGCAAGGGAGGCAGCTGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTA 4824478
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1380 CGCTAACCCGCAAGGGAGGCAGCCGGCCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTA 1439
Query: 4824477 ACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTT 4824435
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1440 ACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTT 1482
>Rhodopseudomonas palustris D84187 (length=1481)
Length = 1481
Minus Strand HSPs:
Score = 7110 (1072.8 bits), Expect = 2.8e-312, P = 2.8e-312
Identities = 1450/1482 (97%), Positives = 1450/1482 (97%), Strand = Minus / Plus
Query: 4825916 AGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAAC 4825857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 AGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAAC 60
Query: 4825856 GGGCATAGCAATATGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGGAACGTACCTTTTGGT 4825797
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 GGGCGTAGCAATACGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTACCTTTTGGT 120
Query: 4825796 TCGGAACAACTGAGGGAAACTTCAGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTA 4825737
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 TCGGAACAACACAGGGAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTA 180
Query: 4825736 TCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGC 4825677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 TCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGC 240
Query: 4825676 GACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAA 4825617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 GACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAA 300
Query: 4825616 ACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCCA 4825557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCCA 360
Query: 4825556 TGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGA 4825497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 TGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGA 420
Query: 4825496 CGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGG 4825437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 CGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGG 480
Query: 4825436 GGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGA 4825377
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct: 481 GGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTTTCTAAGTCAGA 540
Query: 4825376 GGTGAAAGCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGA-TCTTGAGTATGG 4825318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||
Sbjct: 541 GGTGAAAGCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTG-GAAGTCTTGAGTATGG 599
Query: 4825317 GAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCA 4825258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 CAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCA 659
Query: 4825257 GTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCATAACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAA 4825198
||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660 GTGGCGAAGGCGGCTCACTGGGCCATTACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAA 719
Query: 4825197 ACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGT 4825138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 ACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGT 779
Query: 4825137 TTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAG 4825078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 TTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAG 839
Query: 4825077 ATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTC 4825018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840 ATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTC 899
Query: 4825017 GACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAGAGATGTG 4824958
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 900 GACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAGAGACGTG 959
Query: 4824957 ACCTTCTCTTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGA 4824898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 960 ACCTTCTCTTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGA 1019
Query: 4824897 GATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTT 4824838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1020 GATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTT 1079
Query: 4824837 GAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTC 4824778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1080 GAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTC 1139
Query: 4824777 CTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGATGCT 4824718
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 1140 CTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGAAGCT 1199
Query: 4824717 AAGGGGCGACCCTTCGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGAGTCTGCAACT 4824658
|||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 1200 AAGGGGTGACCCTTCGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAACT 1259
Query: 4824657 CGACTCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTT 4824598
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1260 CGAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTT 1319
Query: 4824597 CCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCTGAAGGCAGTG 4824538
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||
Sbjct: 1320 CCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGCTTTACCTGAAGACGGTG 1379
Query: 4824537 CGCTAACCCGCAAGGGAGGCAGCTGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTA 4824478
|||||||| |||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1380 CGCTAACCAGCAATGGGGGCAGCCGGCCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTA 1439
Query: 4824477 ACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTT 4824436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1440 ACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTT 1481
>Afipia genosp. U87768 (length=1453)
Length = 1453
Minus Strand HSPs:
Score = 7101 (1071.5 bits), Expect = 7.4e-312, P = 7.4e-312
Identities = 1437/1455 (98%), Positives = 1437/1455 (98%), Strand = Minus / Plus
Query: 4825899 CAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAACGGGCATAGCAATATGTC 4825840
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct: 1 CAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATCCAAGTCGAACGGGCGTAGCAATACGTC 60
Query: 4825839 AGTGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGGAACGTACCTTTTGGTTCGGAACAACTGAGGGA 4825780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 AGTGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGGAACGTACCTTTTGGTTCGGAACAACTGAGGGA 120
Query: 4825779 AACTTCAGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTATCGCCGAAAGATCGGCC 4825720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 AACTTCAGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTATCGCCGAAAGATCGGCC 180
Query: 4825719 CGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGT 4825660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 CGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGT 240
Query: 4825659 CTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAG 4825600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 CTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAG 300
Query: 4825599 CAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGA 4825540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 CAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGA 360
Query: 4825539 AGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGACGGTACCGCAAGAATAA 4825480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 AGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGACGGTACCGCAAGAATAA 420
Query: 4825479 GCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGA 4825420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 GCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGA 480
Query: 4825419 ATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGAGGTGAAAGCCTGGAGCT 4825360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 ATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGAGGTGAAAGCCTGGAGCT 540
Query: 4825359 CAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTATGGGAGAGGTGAGTGGAACTG 4825300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 CAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTATGGGAGAGGTGAGTGGAACTG 600
Query: 4825299 CGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCAC 4825240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 CGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCAC 660
Query: 4825239 TGGCCCATAACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTG 4825180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 TGGCCCATAACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTG 720
Query: 4825179 GTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGTTTACTCACTAGTGGCGCA 4825120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 GTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGTTTACTCACTAGTGGCGCA 780
Query: 4825119 GCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAAT 4825060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 GCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAAT 840
Query: 4825059 TGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCAACGCGCAGAACC 4825000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 TGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCAACGCGCAGAACC 900
Query: 4824999 TTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAGAGATGTGACCTTCTCTTCGGAGCCT 4824940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 TTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAGAGATGTGACCTTCTCTTCGGAGCCT 960
Query: 4824939 GGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCC 4824880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 GGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCC 1020
Query: 4824879 GCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTGAGCACTCTAAGGAGACT 4824820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 GCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTGAGCACTCTAAGGAGACT 1080
Query: 4824819 GCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGC 4824760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 GCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGC 1140
Query: 4824759 TGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGATGCTAAGGGGCGACCCTTCGCA 4824700
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 1141 TGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGATGCTAAGGGGCGACCCCTCGCA 1200
Query: 4824699 AATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTTGGA 4824640
||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 1201 AATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAACTCGAGCCCATGAAGTTGGA 1260
Query: 4824639 ATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACAC 4824580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 ATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACAC 1320
Query: 4824579 CGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCTGAAGGCAGTGCGCTAACCCGCAAGGGAG 4824520
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||
Sbjct: 1321 CGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTGAAGACGGTGCGCTAACC-GCAAGG-AG 1378
Query: 4824519 GCAGCTGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGG 4824460
||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1379 GCAGCCGGCCACGGTAGGGTCAGTGACTGGGGTGAACTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGG 1438
Query: 4824459 AACCTGCGGCTGGAT 4824445
|||||||||||||||
Sbjct: 1439 AACCTGCGGCTGGAT 1453
WARNING: HSPs involving 12,238 database sequences were not reported due to
the limiting value of parameter B = 10.
Parameters:
E=1e-10
E2=1e-10
B=10
V=10
ucdb
ctxfactor=2.00
Query ----- As Used ----- ----- Computed ----
Strand MatID Matrix name Lambda K H Lambda K H
+1 0 +5,-4 0.192 0.182 0.357 same same same
Q=10,R=10 0.104 0.0151 0.0600 n/a n/a n/a
-1 0 +5,-4 0.192 0.182 0.357 same same same
Q=10,R=10 0.104 0.0151 0.0600 n/a n/a n/a
Query
Strand MatID Length Eff.Length E S W T X E2 S2
+1 0 5,331,656 5,331,656 9.2e-11 498 11 n/a 73 1.0e-10 186
176 0.047 124
-1 0 5,331,656 5,331,656 9.2e-11 498 11 n/a 73 1.0e-10 186
176 0.047 124
Statistics:
Database: /auto/database/rrna/16S.fasta
Title: 16S.fasta
Posted: 5:13:55 PM EST Dec 15, 2004
Created: 5:13:54 PM EST Dec 15, 2004
Format: XDF-1
# of letters in database: 17,852,017
# of sequences in database: 12,250
# of database sequences satisfying E: 12,248
No. of states in DFA: 1,159,959 (81,560 KB)
Total size of DFA: 139,685 KB (140,803 KB)
Time to generate neighborhood: 21.43u 0.62s 22.05t Elapsed: 00:00:22
No. of threads or processors used: 1
Search cpu time: 88.53u 0.21s 88.74t Elapsed: 00:01:29
Total cpu time: 110.02u 0.87s 110.89t Elapsed: 00:01:52
Start: Tue Nov 1 10:14:16 2005 End: Tue Nov 1 10:16:08 2005
WARNINGS ISSUED: 3
SiteMap
Feedback
Life Sciences Division
ORNL
Disclaimer
Webmaster
![[space]](http://homer.ornl.gov/compbio/public/images/bluespacer.gif){kind=small}
![[space]](http://maple.lsd.ornl.gov/common/images/bluespacer.gif){kind=small}