BLASTN 2.0MP-WashU [26-Mar-2005] [linux26-i686-ILP32F64 2005-03-26T23:28:52]
Copyright (C) 1996-2005 Washington University, Saint Louis, Missouri USA.
All Rights Reserved.
Reference: Gish, W. (1996-2005) http://blast.wustl.edu
Notice: this program and its default parameter settings are optimized to find
nearly identical sequences rapidly. To identify weak protein similarities
encoded in nucleic acid, use BLASTX, TBLASTN or TBLASTX.
Query= Contig6
(3,402,093 letters)
WARNING: Use of the hspsepQmax parameter should be considered with long query
sequences, to improve the biological relevance of the HSP groups
that are assembled and to improve the statistical discrimination of
these groups from random background.
Database: 16S.fasta
12,250 sequences; 17,852,017 total letters.
Searching....10....20....30....40....50....60....70....80....90....100% done
Smallest
Sum
High Probability
Sequences producing High-scoring Segment Pairs: Score P(N) N
Bradyrhizobium japonicum U69638 (length=1489) 7256 4.7e-319 1
Nitrobacter sp. L11662 (length=1464) 7214 3.7e-317 1
Nitrobacter winogradskyi L11661 (length=1458) 7201 1.4e-316 1
Bradyrhizobium lupini X87273 (length=1484) 7198 1.9e-316 1
Bradyrhizobium lupini U69637 (length=1481) 7183 9.1e-316 1
Bradyrhizobium japonicum Z35330 (length=1490) 7180 1.2e-315 1
Rhodopseudomonas palustris AF184625 (length=1489) 7159 1.1e-314 1
Rhodopseudomonas palustris AF184626 (length=1489) 7159 1.1e-314 1
Afipia genosp. U87766 (length=1488) 7137 1.1e-313 1
Bradyrhizobium japonicum X87272 (length=1484) 7135 1.3e-313 1
WARNING: Descriptions of 12,238 database sequences were not reported due to
the limiting value of parameter V = 10.
>Bradyrhizobium japonicum U69638 (length=1489)
Length = 1489
Plus Strand HSPs:
Score = 7256 (1094.7 bits), Expect = 4.7e-319, P = 4.7e-319
Identities = 1468/1489 (98%), Positives = 1468/1489 (98%), Strand = Plus / Plus
Query: 638311 GAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAACG 638370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 1 GAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAGCG 60
Query: 638371 GGCGTAGCAATACGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTACCTTTTGGTT 638430
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 GGCGTAGCAATACGTCAGCGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTACCTTTTGGTT 120
Query: 638431 CGGAACAACCCAGGGAAACTTGGGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTAT 638490
||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 CGGAACAACACAGGGAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTAT 180
Query: 638491 CGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTTGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCG 638550
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 181 CGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCG 240
Query: 638551 ACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAA 638610
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAA 300
Query: 638611 CTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCAT 638670
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||
Sbjct: 301 CTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGGGCAACCCTGATCCAGCCAT 360
Query: 638671 GCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGAC 638730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 GCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGAC 420
Query: 638731 GGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGG 638790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 GGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGG 480
Query: 638791 GCTAGCGTTGCTCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGGG 638850
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 GCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGGG 540
Query: 638851 GTGAAATCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTTCGGGA 638910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 GTGAAATCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTTCGGGA 600
Query: 638911 GAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGT 638970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 GAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGT 660
Query: 638971 GGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCGATACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAAC 639030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 GGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCGATACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAAC 720
Query: 639031 AGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGTTT 639090
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 AGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGTTT 780
Query: 639091 ACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGAT 639150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 ACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGAT 840
Query: 639151 TAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGA 639210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 TAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGA 900
Query: 639211 CGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCATGACCGGTCGCAGAGATGTGAC 639270
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 CGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAGAGATGTGAC 960
Query: 639271 CTTCTCTTCGGAGCATGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGA 639330
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 CTTCTCTTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGA 1020
Query: 639331 TGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTGA 639390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 TGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTGA 1080
Query: 639391 GCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCT 639450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 GCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCT 1140
Query: 639451 CATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGAAGCAAA 639510
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct: 1141 CATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGATGCTAA 1200
Query: 639511 GGGGTGACCCCTAGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAACCCG 639570
|||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 1201 GGGGCGACCCTTCGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAACTCG 1260
Query: 639571 AGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTCC 639630
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 AGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCACGCCACGGTGAATACGTTCC 1320
Query: 639631 CGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTGAAGGCGGTGCG 639690
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 1321 CGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTGAAGACGGTGCG 1380
Query: 639691 CTAACCCGCAAGGGAGGCAGCCGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAAC 639750
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 CTAACCCGCAAGGGAGGCAGCCGGCCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAAC 1440
Query: 639751 AAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGAT 639799
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 AAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGAT 1489
>Nitrobacter sp. L11662 (length=1464)
Length = 1464
Plus Strand HSPs:
Score = 7214 (1088.4 bits), Expect = 3.7e-317, P = 3.7e-317
Identities = 1454/1466 (99%), Positives = 1454/1466 (99%), Strand = Plus / Plus
Query: 638317 GATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAACGGGCGTA 638376
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 GATCTTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAACGGGCGTA 60
Query: 638377 GCAATACGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTACCTTTTGGTTCGGAAC 638436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 GCAATACGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTACCTTTTGGTTCGGAAC 120
Query: 638437 AACCCAGGGAAACTTGGGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTATCGCCGA 638496
||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 AACACAGGGAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTATCGCCGA 180
Query: 638497 AAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTTGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATC 638556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 AAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTTGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATC 240
Query: 638557 AGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTA 638616
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 AGTAGCNGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTA 300
Query: 638617 CGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCG 638676
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 CGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCG 360
Query: 638677 TGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGACGGTACC 638736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 TGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGACGGTACC 420
Query: 638737 GCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGC 638796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 GCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGC 480
Query: 638797 GTTGCTCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGGGGTGAAA 638856
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 481 GTTGCTCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGAGGTGAAA 540
Query: 638857 TCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTTCGGGAGAGGTG 638916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 TCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTTCGGGAGAGGTG 600
Query: 638917 AGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCGAA 638976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 AGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCGAA 660
Query: 638977 GGCGGCTCACTGGCCCGATACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATT 639036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 GGCGGCTCACTGGCCCGATACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATT 720
Query: 639037 AGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGTTTACTCAC 639096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 AGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGTTTACTCAC 780
Query: 639097 TAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAAC 639156
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 TAGTGGCGCACGTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAAC 840
Query: 639157 TCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCAAC 639216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 TCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCAAC 900
Query: 639217 GCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCATGACCGGTCGCAGAGATGTGACCTTCTC 639276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 GCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCATGACCGGTCGCAGAGATGTGACCTTCTC 960
Query: 639277 TTCGGAGCATGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGG 639336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 TTCGGAGCATGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGG 1020
Query: 639337 GTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTGAGCACTC 639396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 GTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTGAGCACTC 1080
Query: 639397 TAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGC 639456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 TAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGC 1140
Query: 639457 CCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGAAGCAAAGGGGTG 639516
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 CCTTACGGGCTGN-CTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGAAGCAAAGGGGCA 1199
Query: 639517 ACCCCTAGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAACCCGAGCCCA 639576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1200 ACCCCTAGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAACCCGAGCCCA 1259
Query: 639577 TGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCC 639636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1260 TGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCC 1319
Query: 639637 TTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTGAAGGCGGTGCGCTAACC 639696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1320 TTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTGAAGGCGGTGCGCTAACC 1379
Query: 639697 CGCAAGGGAGGCAGCCGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA 639756
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1380 CGCAAGG-AGGCAGCCGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA 1438
Query: 639757 GCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATC 639782
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1439 GCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATC 1464
>Nitrobacter winogradskyi L11661 (length=1458)
Length = 1458
Plus Strand HSPs:
Score = 7201 (1086.5 bits), Expect = 1.4e-316, P = 1.4e-316
Identities = 1457/1466 (99%), Positives = 1457/1466 (99%), Strand = Plus / Plus
Query: 638317 GATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAACGGGCGTA 638376
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 GATCTTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAACGGGCGTA 60
Query: 638377 GCAATACGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTACCTTTTGGTTCGGAAC 638436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 GCAATACGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTACCTTTTGGTTCGGAAC 120
Query: 638437 AACCCAGGGAAACTTGGGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTATCGCCGA 638496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 AACCCAGGGAAACTTGGGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTATCGCCGA 180
Query: 638497 AAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTTGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATC 638556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 AAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTTGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATC 240
Query: 638557 AGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTA 638616
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct: 241 AGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCC-AAACTC-TA 298
Query: 638617 CGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCG 638676
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 299 CGGG---CAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCG 355
Query: 638677 TGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGACGGTACC 638736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 356 TGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGACGGTACC 415
Query: 638737 GCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGC 638796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 416 GCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGC 475
Query: 638797 GTTGCTCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGGGGTGAAA 638856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 476 GTTGCTCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGGGGTGAAA 535
Query: 638857 TCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTTCGGGAGAGGTG 638916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 536 TCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTTCGGGAGAGGTG 595
Query: 638917 AGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCGAA 638976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 596 AGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAGTGGCGAA 655
Query: 638977 GGCGGCTCACTGGCCCGATACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATT 639036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 656 GGCGGCTCACTGGCCCGATACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATT 715
Query: 639037 AGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGTTTACTCAC 639096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 716 AGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGTTTACTCAC 775
Query: 639097 TAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAAC 639156
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 776 TAGTGGCGCA-CTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAAC 834
Query: 639157 TCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCAAC 639216
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 835 TCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGA-GCAAC 893
Query: 639217 GCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCATGACCGGTCGCAGAGATGTGACCTTCTC 639276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 894 GCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCATGACCGGTCGCAGAGATGTGACCTTCTC 953
Query: 639277 TTCGGAGCATGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGG 639336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 954 TTCGGAGCATGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGG 1013
Query: 639337 GTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTGAGCACTC 639396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1014 GTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTGAGCACTC 1073
Query: 639397 TAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGC 639456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1074 TAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGC 1133
Query: 639457 CCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGAAGCAAAGGGGTG 639516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1134 CCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGAAGCAAAGGGGTG 1193
Query: 639517 ACCCCTAGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAACCCGAGCCCA 639576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1194 ACCCCTAGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAACCCGAGCCCA 1253
Query: 639577 TGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCC 639636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1254 TGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCC 1313
Query: 639637 TTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTGAAGGCGGTGCGCTAACC 639696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1314 TTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTGAAGGCGGTGCGCTAACC 1373
Query: 639697 CGCAAGGGAGGCAGCCGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA 639756
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1374 CGCAAGG-AGGCAGCCGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA 1432
Query: 639757 GCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATC 639782
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1433 GCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATC 1458
>Bradyrhizobium lupini X87273 (length=1484)
Length = 1484
Plus Strand HSPs:
Score = 7198 (1086.0 bits), Expect = 1.9e-316, P = 1.9e-316
Identities = 1458/1482 (98%), Positives = 1458/1482 (98%), Strand = Plus / Plus
Query: 638310 AGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAAC 638369
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 1 AGAGTTTGATNNTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAGC 60
Query: 638370 GGGCGTAGCAATACGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTACCTTTTGGT 638429
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 GGGCGTAGCAATACGTCAGCGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTACCTTTTGGT 120
Query: 638430 TCGGAACAACCCAGGGAAACTTGGGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTA 638489
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 TCGGAACAACACAGGGAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTA 180
Query: 638490 TCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTTGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGC 638549
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 181 TCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGC 240
Query: 638550 GACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAA 638609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 GACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAA 300
Query: 638610 ACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCA 638669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct: 301 ACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGGGCAACCCTGATCCAGCCA 360
Query: 638670 TGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGA 638729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 TGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGA 420
Query: 638730 CGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGG 638789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 CGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGG 480
Query: 638790 GGCTAGCGTTGCTCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGG 638849
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 GGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGG 540
Query: 638850 GGTGAAATCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTTCGGG 638909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 GGTGAAATCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTTCGGG 600
Query: 638910 AGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAG 638969
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 AGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAG 660
Query: 638970 TGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCGATACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAA 639029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 TGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCGATACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAA 720
Query: 639030 CAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGTT 639089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 CAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGTT 780
Query: 639090 TACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGA 639149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 TACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGA 840
Query: 639150 TTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCG 639209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 TTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCG 900
Query: 639210 ACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCATGACCGGTCGCAGAGATGTGA 639269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 ACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAGAGATGTGA 960
Query: 639270 CCTTCTCTTCGGAGCATGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAG 639329
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 CCTTCTCTTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAG 1020
Query: 639330 ATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTG 639389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 ATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTG 1080
Query: 639390 AGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCC 639449
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 AGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTCATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCC 1140
Query: 639450 TCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGAAGCAA 639509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct: 1141 TCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGATGCTA 1200
Query: 639510 AGGGGTGACCCCTAGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAACCC 639569
||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 1201 AGGGGCGACCCTTCGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAACTC 1260
Query: 639570 GAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTC 639629
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 GAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCACGCCACGGTGAATACGTTC 1320
Query: 639630 CCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTGAAGGCGGTGC 639689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 1321 CCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTGAAGACGGTGC 1380
Query: 639690 GCTAACCCGCAAGGGAGGCAGCCGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAA 639749
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 GCTAACCCGCAAGGGAGGCAGCCGGCCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAA 1440
Query: 639750 CAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTT 639791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 CAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTT 1482
>Bradyrhizobium lupini U69637 (length=1481)
Length = 1481
Plus Strand HSPs:
Score = 7183 (1083.8 bits), Expect = 9.1e-316, P = 9.1e-316
Identities = 1457/1481 (98%), Positives = 1457/1481 (98%), Strand = Plus / Plus
Query: 638309 GAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAA 638368
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 GCGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAG 61
Query: 638369 CGGGCGTAGCAATACGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTACCTTTTGG 638428
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 CGGGCGTAGCAATACGTCAGCGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTACCTTTTGG 121
Query: 638429 TTCGGAACAACCCAGGGAAACTTGGGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTT 638488
||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 TTCGGAACAACACAGGGAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTT 181
Query: 638489 ATCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTTGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGG 638548
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 182 ATCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGG 241
Query: 638549 CGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCA 638608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 CGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCA 301
Query: 638609 AACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCC 638668
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct: 302 AACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGGGCAACCCTGATCCAGCC 361
Query: 638669 ATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATG 638728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 ATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATG 421
Query: 638729 ACGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGG 638788
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 ACGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGG 481
Query: 638789 GGGCTAGCGTTGCTCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAG 638848
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 GGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAG 541
Query: 638849 GGGTGAAATCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTTCGG 638908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 542 GGGTGAAATCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAAGATCTTGAGTTCGG 601
Query: 638909 GAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCA 638968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 GAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCA 661
Query: 638969 GTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCGATACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAA 639028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 GTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCGATACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAA 721
Query: 639029 ACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGT 639088
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 722 ACAGGAT-AGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGT 780
Query: 639089 TTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAG 639148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 TTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAG 840
Query: 639149 ATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTC 639208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 ATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTC 900
Query: 639209 GACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCATGACCGGTCGCAGAGATGTG 639268
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 901 GACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAGAGATGTG 960
Query: 639269 ACCTTCTCTTCGGAGCATGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGA 639328
|||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 ACCTTCTCTTCGGAGCCTGGAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGA 1020
Query: 639329 GATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTT 639388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 GATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTT 1080
Query: 639389 GAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTC 639448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 GAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTC 1140
Query: 639449 CTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGAAGCA 639508
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 1141 CTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGATGCT 1200
Query: 639509 AAGGGGTGACCCCTAGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAACC 639568
|||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 AAGGGGTGACCCTTCGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAACT 1260
Query: 639569 CGAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTT 639628
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 1261 CGAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCACGCCACGGTGAATACGTT 1320
Query: 639629 CCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTGAAGGCGGTG 639688
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 1321 CCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTGAAGACGGTG 1380
Query: 639689 CGCTAACCCGCAAGGGAGGCAGCCGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTA 639748
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 CGCTAACCCGCAAGGGAGGCAGCCGGCCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTA 1440
Query: 639749 ACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCT 639789
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 ACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCT 1481
>Bradyrhizobium japonicum Z35330 (length=1490)
Length = 1490
Plus Strand HSPs:
Score = 7180 (1083.3 bits), Expect = 1.2e-315, P = 1.2e-315
Identities = 1460/1490 (97%), Positives = 1460/1490 (97%), Strand = Plus / Plus
Query: 638302 CCAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCA 638361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 CCAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCA 60
Query: 638362 AGTCGAACGGGCGTAGCAATACGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTAC 638421
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 AGTCGAGCGGGCGTAGCAATACGTCAGCGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTAC 120
Query: 638422 CTTTTGGTTCGGAACAACCCAGGGAAACTTGGGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGA 638481
|||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 CTTTTGGTTCGGAACAACACAGGGAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGA 180
Query: 638482 AAGATTTATCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTTGTTGGTGAGGTAACGGCTC 638541
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct: 181 AAGATTTATCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTAGGGTAACGGCCT 240
Query: 638542 ACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACA 638601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACA 300
Query: 638602 CGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGA 638661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct: 301 CGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGGGCAACCCTGA 360
Query: 638662 TCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAA 638721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 TCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAA 420
Query: 638722 GATAATGACGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAAT 638781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 GATAATGACGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAAT 480
Query: 638782 ACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTT 638841
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 ACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTT 540
Query: 638842 AAGTCAGGGGTGAAATCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTG 638901
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 541 AAGTCAGGGGTGAAATCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAAGATCTTG 600
Query: 638902 AGTTCGGGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAG 638961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 AGTTCGGGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAG 660
Query: 638962 AACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCGATACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGG 639021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 AACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCGATACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGG 720
Query: 639022 GGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTT 639081
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 GGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTT 780
Query: 639082 AGTGGGTTTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGG 639141
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 AGTGGGTTTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGG 840
Query: 639142 TCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGT 639201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 TCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGT 900
Query: 639202 TTAATTCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCATGACCGGTCGCAG 639261
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 901 TTAATTCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAG 960
Query: 639262 AGATGTGACCTTCTCTTCGGAGCATGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGT 639321
||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 AGATGTGACCTTCTCTTCGGAGCCTGGAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGT 1020
Query: 639322 GTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCA 639381
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 GTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCA 1080
Query: 639382 TTTAGTTGAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACG 639441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 1081 TTTAGTTGAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGGCG 1140
Query: 639442 TCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATG 639501
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 TCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATG 1200
Query: 639502 GGAAGCAAAGGGGTGACCCCTAGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTC 639561
||| || |||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 GGATGCTAAGGGGCGACCCTTCGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTC 1260
Query: 639562 TGCAACCCGAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGA 639621
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 1261 TGCAACTCGAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCACGCCACGGTGA 1320
Query: 639622 ATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTGAA 639681
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 1321 ATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGCTTTACCTGAA 1380
Query: 639682 GGCGGTGCGCTAACCCGCAAGGGAGGCAGCCGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGA 639741
| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 GACGGTGCGCTAACCAGCAATGGAGGCAGCCGGCCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGA 1440
Query: 639742 AGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTT 639791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 AGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTT 1490
>Rhodopseudomonas palustris AF184625 (length=1489)
Length = 1489
Plus Strand HSPs:
Score = 7159 (1080.2 bits), Expect = 1.1e-314, P = 1.1e-314
Identities = 1459/1490 (97%), Positives = 1459/1490 (97%), Strand = Plus / Plus
Query: 638301 TCCAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGC 638360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 TCCAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGC 60
Query: 638361 AAGTCGAACGGGCGTAGCAATACGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTA 638420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 AAGTCGAACGGGCGTAGCAATACGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTA 120
Query: 638421 CCTTTTGGTTCGGAACAACCCAGGGAAACTTGGGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGG 638480
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 CCTTTTGGTTCGGAACAACACAGGGAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGG 180
Query: 638481 AAAGATTTATCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTTGTTGGTGAGGTAACGGCT 638540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct: 181 AAAGATTTATCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCT 240
Query: 638541 CACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGAC 638600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 CACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGAC 300
Query: 638601 ACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTG 638660
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 301 ACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTG 360
Query: 638661 ATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGA 638720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGA 420
Query: 638721 AGATAATGACGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAA 638780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 AGATAATGACGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAA 480
Query: 638781 TACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTT 638840
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 481 TACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTTTC 540
Query: 638841 TAAGTCAGGGGTGAAATCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGA-TCT 638899
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||
Sbjct: 541 TAAGTCAGAGGTGAAAGCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTG-GAAGTCT 599
Query: 638900 TGAGTTCGGGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCA 638959
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 TGAGTATGGCAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCA 659
Query: 638960 AGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCGATACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGT 639019
|||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660 AGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGGCCATTACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGT 719
Query: 639020 GGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCG 639079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 GGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCG 779
Query: 639080 TTAGTGGGTTTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTAC 639139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 TTAGTGGGTTTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTAC 839
Query: 639140 GGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTG 639199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840 GGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTG 899
Query: 639200 GTTTAATTCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCATGACCGGTCGC 639259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 900 GTTTAATTCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGC 959
Query: 639260 AGAGATGTGACCTTCTCTTCGGAGCATGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTC 639319
||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 960 AGAGACGTGACCTTCTCTTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTC 1019
Query: 639320 GTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTAC 639379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1020 GTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTAC 1079
Query: 639380 CATTTAGTTGAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGA 639439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1080 CATTTAGTTGAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGA 1139
Query: 639440 CGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAA 639499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1140 CGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAA 1199
Query: 639500 TGGGAAGCAAAGGGGTGACCCCTAGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGGC 639559
|||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 1200 TGGGAAGCTAAGGGGTGACCCTTCGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGGC 1259
Query: 639560 TCTGCAACCCGAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGT 639619
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1260 TCTGCAACTCGAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGT 1319
Query: 639620 GAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTG 639679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 1320 GAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGCTTTACCTG 1379
Query: 639680 AAGGCGGTGCGCTAACCCGCAAGGGAGGCAGCCGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGT 639739
||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1380 AAGACGGTGCGCTAACCCGCAAGGGGGGCAGCCGGCCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGT 1439
Query: 639740 GAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCT 639789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1440 GAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCT 1489
>Rhodopseudomonas palustris AF184626 (length=1489)
Length = 1489
Plus Strand HSPs:
Score = 7159 (1080.2 bits), Expect = 1.1e-314, P = 1.1e-314
Identities = 1459/1490 (97%), Positives = 1459/1490 (97%), Strand = Plus / Plus
Query: 638301 TCCAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGC 638360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 TCCAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGC 60
Query: 638361 AAGTCGAACGGGCGTAGCAATACGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTA 638420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 AAGTCGAACGGGCGTAGCAATACGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTA 120
Query: 638421 CCTTTTGGTTCGGAACAACCCAGGGAAACTTGGGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGG 638480
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 CCTTTTGGTTCGGAACAACACAGGGAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGG 180
Query: 638481 AAAGATTTATCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTTGTTGGTGAGGTAACGGCT 638540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct: 181 AAAGATTTATCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCT 240
Query: 638541 CACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGAC 638600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 CACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGAC 300
Query: 638601 ACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTG 638660
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 301 ACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTG 360
Query: 638661 ATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGA 638720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGA 420
Query: 638721 AGATAATGACGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAA 638780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 AGATAATGACGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAA 480
Query: 638781 TACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTT 638840
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 481 TACGAAGGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTTTC 540
Query: 638841 TAAGTCAGGGGTGAAATCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGA-TCT 638899
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||
Sbjct: 541 TAAGTCAGAGGTGAAAGCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTG-GAAGTCT 599
Query: 638900 TGAGTTCGGGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCA 638959
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 TGAGTATGGCAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCA 659
Query: 638960 AGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCGATACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGT 639019
|||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660 AGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGGCCATTACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGT 719
Query: 639020 GGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCG 639079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 GGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCG 779
Query: 639080 TTAGTGGGTTTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTAC 639139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 TTAGTGGGTTTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTAC 839
Query: 639140 GGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTG 639199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840 GGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTG 899
Query: 639200 GTTTAATTCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCATGACCGGTCGC 639259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 900 GTTTAATTCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGC 959
Query: 639260 AGAGATGTGACCTTCTCTTCGGAGCATGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTC 639319
||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 960 AGAGACGTGACCTTCTCTTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTC 1019
Query: 639320 GTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTAC 639379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1020 GTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTAC 1079
Query: 639380 CATTTAGTTGAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGA 639439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1080 CATTTAGTTGAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGA 1139
Query: 639440 CGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAA 639499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1140 CGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAA 1199
Query: 639500 TGGGAAGCAAAGGGGTGACCCCTAGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGGC 639559
|||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 1200 TGGGAAGCTAAGGGGTGACCCTTCGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGGC 1259
Query: 639560 TCTGCAACCCGAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGT 639619
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1260 TCTGCAACTCGAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGT 1319
Query: 639620 GAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTG 639679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 1320 GAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGCTTTACCTG 1379
Query: 639680 AAGGCGGTGCGCTAACCCGCAAGGGAGGCAGCCGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGT 639739
||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1380 AAGACGGTGCGCTAACCCGCAAGGGGGGCAGCCGGCCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGT 1439
Query: 639740 GAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCT 639789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1440 GAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCT 1489
>Afipia genosp. U87766 (length=1488)
Length = 1488
Plus Strand HSPs:
Score = 7137 (1076.9 bits), Expect = 1.1e-313, P = 1.1e-313
Identities = 1455/1485 (97%), Positives = 1455/1485 (97%), Strand = Plus / Plus
Query: 638307 TTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCG 638366
|| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 2 TTAAGAGTT-GATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATCCAAGTCG 60
Query: 638367 AACGGGCGTAGCAATACGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTACCTTTT 638426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 61 AACGGGCGTAGCAATACGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACACGTGGGAACGTACCTTTT 120
Query: 638427 GGTTCGGAACAACCCAGGGAAACTTGGGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGAT 638486
||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 GGTTCGGAACAACTGAGGGAAACTTCAGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGAT 180
Query: 638487 TTATCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTTGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAA 638546
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 181 TTATCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAA 240
Query: 638547 GGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCC 638606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 GGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCC 300
Query: 638607 CAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAG 638666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 CAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAG 360
Query: 638667 CCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAA 638726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 CCATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAA 420
Query: 638727 TGACGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAA 638786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 TGACGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAA 480
Query: 638787 GGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTC 638846
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 GGGGGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTC 540
Query: 638847 AGGGGTGAAATCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTTC 638906
|| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 AGAGGTGAAAGCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTAT 600
Query: 638907 GGGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACAC 638966
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 GGGAGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACAC 660
Query: 638967 CAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCGATA-CTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAG 639025
|||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 CAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCC-ATAACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAG 719
Query: 639026 CAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTG 639085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 CAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTG 779
Query: 639086 GGTTTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGC 639145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 GGTTTACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGC 839
Query: 639146 AAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAA 639205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840 AAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAA 899
Query: 639206 TTCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCATGACCGGTCGCAGAGAT 639265
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 900 TTCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAGAGAT 959
Query: 639266 GTGACCTTCTCTTCGGAGCATGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCG 639325
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 960 GTGACCTTCTCTTCGGAGCCTGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCG 1019
Query: 639326 TGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTA 639385
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1020 TGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTA 1079
Query: 639386 GTTGAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAA 639445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1080 GTTGAGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAA 1139
Query: 639446 GTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGAA 639505
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1140 GTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGAT 1199
Query: 639506 GCAAAGGGGTGACCCCTAGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCA 639565
|| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1200 GCTAAGGGGCGACCCCTCGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCA 1259
Query: 639566 ACCCGAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATAC 639625
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1260 ACTCGAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATAC 1319
Query: 639626 GTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTGAAGGCG 639685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct: 1320 GTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGCTTTACCTGAAGACG 1379
Query: 639686 GTGCGCTAACCCGCAAGGGAGGCAGCCGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTC 639745
||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1380 GTGCGCTAACCAGCAATGGAGGCAGCCGGCCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTC 1439
Query: 639746 GTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTT 639790
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1440 GTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTT 1484
>Bradyrhizobium japonicum X87272 (length=1484)
Length = 1484
Plus Strand HSPs:
Score = 7135 (1076.6 bits), Expect = 1.3e-313, P = 1.3e-313
Identities = 1451/1482 (97%), Positives = 1451/1482 (97%), Strand = Plus / Plus
Query: 638310 AGAGTTTGATCCTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAAC 638369
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 1 AGAGTTTGATNNTGGCTCAGAGCGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGCAAGTCGAGC 60
Query: 638370 GGGCGTAGCAATACGTCAGTGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTACCTTTTGGT 638429
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 GGGCGTAGCAATACGTCAGCGGCAGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTACCTTTTGGT 120
Query: 638430 TCGGAACAACCCAGGGAAACTTGGGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTA 638489
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 TCGGAACAACACAGGGAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGCCCTTACGGGGAAAGATTTA 180
Query: 638490 TCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTTGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGC 638549
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct: 181 TCGCCGAAAGATCGGCCCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTAGGGTAACGGCCTACCAAGGC 240
Query: 638550 GACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAA 638609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 GACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAA 300
Query: 638610 ACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCA 638669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct: 301 ACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGGGCAACCCTGATCCAGCCA 360
Query: 638670 TGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGA 638729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 TGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTGTGCGGGAAGATAATGA 420
Query: 638730 CGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGG 638789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 CGGTACCGCAAGAATAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGG 480
Query: 638790 GGCTAGCGTTGCTCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGG 638849
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 GGCTAGCGTTGCTCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGTGCGTAGGCGGGTCTTTAAGTCAGG 540
Query: 638850 GGTGAAATCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAGGATCTTGAGTTCGGG 638909
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 541 GGTGAAATCCTGGAGCTCAACTCCAGAACTGCCTTTGATACTGAAGATCTTGAGTTCGGG 600
Query: 638910 AGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAG 638969
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 AGAGGTGAGTGGAACTGCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGCAAGAACACCAG 660
Query: 638970 TGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCGATACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAA 639029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 TGGCGAAGGCGGCTCACTGGCCCGATACTGACGCTGAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAA 720
Query: 639030 CAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGTT 639089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 CAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGCCGTTAGTGGGTT 780
Query: 639090 TACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGA 639149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 TACTCACTAGTGGCGCAGCTAACGCTTTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGA 840
Query: 639150 TTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCG 639209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 TTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCG 900
Query: 639210 ACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCATGACCGGTCGCAGAGATGTGA 639269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 ACGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCCTTGACATGTCCAGGACCGGTCGCAGAGATGTGA 960
Query: 639270 CCTTCTCTTCGGAGCATGGAGCACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAG 639329
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 CCTTCTCTTCGGAGCCTGGAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAG 1020
Query: 639330 ATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTG 639389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 ATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGTCCTTAGTTGCTACCATTTAGTTG 1080
Query: 639390 AGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCC 639449
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 AGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAGCCGCGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCC 1140
Query: 639450 TCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGAAGCAA 639509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct: 1141 TCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAATGGGATGCTA 1200
Query: 639510 AGGGGTGACCCCTAGCAAATCTCAAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAACCC 639569
||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 1201 AGGGGCGACCCTTCGCAAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGGGCTCTGCAACTC 1260
Query: 639570 GAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTC 639629
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 GAGCCCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCACGCCACGGTGAATACGTTC 1320
Query: 639630 CCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTTTACCTGAAGGCGGTGC 639689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct: 1321 CCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGCTTTACCTGAAGACGGTGC 1380
Query: 639690 GCTAACCCGCAAGGGAGGCAGCCGACCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAA 639749
||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 GCTAACCTGCAAAGGAGGCAGCCGGCCACGGTAGGGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAA 1440
Query: 639750 CAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTT 639791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 CAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTT 1482
WARNING: HSPs involving 12,238 database sequences were not reported due to
the limiting value of parameter B = 10.
Parameters:
E=1e-10
E2=1e-10
B=10
V=10
ucdb
ctxfactor=2.00
Query ----- As Used ----- ----- Computed ----
Strand MatID Matrix name Lambda K H Lambda K H
+1 0 +5,-4 0.192 0.182 0.357 same same same
Q=10,R=10 0.104 0.0151 0.0600 n/a n/a n/a
-1 0 +5,-4 0.192 0.182 0.357 same same same
Q=10,R=10 0.104 0.0151 0.0600 n/a n/a n/a
Query
Strand MatID Length Eff.Length E S W T X E2 S2
+1 0 3,402,093 3,402,093 9.9e-11 493 11 n/a 73 1.0e-10 186
171 0.047 124
-1 0 3,402,093 3,402,093 9.9e-11 493 11 n/a 73 1.0e-10 186
171 0.047 124
Statistics:
Database: /auto/database/rrna/16S.fasta
Title: 16S.fasta
Posted: 5:13:55 PM EST Dec 15, 2004
Created: 5:13:54 PM EST Dec 15, 2004
Format: XDF-1
# of letters in database: 17,852,017
# of sequences in database: 12,250
# of database sequences satisfying E: 12,248
No. of states in DFA: 1,192,164 (83,825 KB)
Total size of DFA: 127,944 KB (128,110 KB)
Time to generate neighborhood: 13.79u 0.47s 14.26t Elapsed: 00:00:14
No. of threads or processors used: 2
Search cpu time: 26.98u 0.11s 27.09t Elapsed: 00:00:53
Total cpu time: 40.83u 0.62s 41.45t Elapsed: 00:01:09
Start: Thu Aug 11 14:55:14 2005 End: Thu Aug 11 14:56:23 2005
WARNINGS ISSUED: 3
SiteMap
Feedback
Life Sciences Division
ORNL
Disclaimer
Webmaster
![[space]](http://homer.ornl.gov/compbio/public/images/bluespacer.gif){kind=small}
![[space]](http://maple.lsd.ornl.gov/common/images/bluespacer.gif){kind=small}