BLASTN 2.0MP-WashU [26-Mar-2005] [linux26-i686-ILP32F64 2005-03-26T23:28:52]
Copyright (C) 1996-2005 Washington University, Saint Louis, Missouri USA.
All Rights Reserved.
Reference: Gish, W. (1996-2005) http://blast.wustl.edu
Notice: this program and its default parameter settings are optimized to find
nearly identical sequences rapidly. To identify weak protein similarities
encoded in nucleic acid, use BLASTX, TBLASTN or TBLASTX.
Query= Contig12
(3,184,243 letters)
WARNING: Use of the hspsepQmax parameter should be considered with long query
sequences, to improve the biological relevance of the HSP groups
that are assembled and to improve the statistical discrimination of
these groups from random background.
Database: 16S.fasta
12,250 sequences; 17,852,017 total letters.
Searching....10....20....30....40....50....60....70....80....90....100% done
Smallest
Sum
High Probability
Sequences producing High-scoring Segment Pairs: Score P(N) N
Nitrosolobus multiformis L35509 (length=1478) 7369 0. 1
Nitrosospira briensis L35505 (length=1458) 7104 3.2e-312 1
Nitrosovibrio tenuis M96397 (length=1435) 6941 7.5e-305 1
Nitrosospira sp. X90820 (length=1418) 6928 2.9e-304 1
Nitrosovibrio tenuis M96405 (length=1434) 6921 6.0e-304 1
Nitrosospira briensis M96396 (length=1448) 6918 8.1e-304 1
Nitrosovibrio sp. AF080256 (length=1447) 6876 6.4e-302 1
Nitrosospira sp. AJ000344 (length=1400) 6718 9.1e-295 1
Nitrosospira sp. AJ000345 (length=1401) 6711 1.9e-294 1
Nitrosovibrio tenuis M96404 (length=1378) 6670 1.4e-292 1
WARNING: Descriptions of 12,237 database sequences were not reported due to
the limiting value of parameter V = 10.
>Nitrosolobus multiformis L35509 (length=1478)
Length = 1478
Plus Strand HSPs:
Score = 7369 (1111.7 bits), Expect = 0., P = 0.
Identities = 1475/1478 (99%), Positives = 1475/1478 (99%), Strand = Plus / Plus
Query: 562629 AGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATGCAAGTCGAAC 562688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 AGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATGCAAGTCGAAC 60
Query: 562689 GGCAGCACGGGGGCAACCCTGGTGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAATACATCGGAACGT 562748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 GGCAGCACGGGGGCAACCCTGGTGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAATACATCGGAACGT 120
Query: 562749 ATCCTTAAGTGGGGGATAACGCACCGAAAGGTGTGCTAATACCGCATAATCTCCGAGGAG 562808
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ATCCTTAAGTGGGGGATAACGCACCGAAAGGTGTGCTAATACCGCATAATCTCCGAGGAG 180
Query: 562809 AAAAGCAGGGGATCGCAAGACCTTGCGCTTTTGGAGCGGCCGATGTCTGATTAGCTAGTT 562868
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 AAAAGCAGGGGATCGCAAGACCTTGCGCTTTTGGAGCGGCCGATGTCTGATTAGCTAGTT 240
Query: 562869 GGTGAGGTAAAGGCTTACCAAGGCGTCGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGACGACCAGCCA 562928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 GGTGAGGTAAAGGCTTACCAAGGCGTCGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGACGACCAGCCA 300
Query: 562929 CACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACA 562988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 CACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACA 360
Query: 562989 ATGGGGGAAACCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAG 563048
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ATGGGGGAAACCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAG 420
Query: 563049 CTCTTTCAGCCGGAACGAAACGGTCACGGTTAATACCCGTGACTACTGACGGTACCGGAA 563108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 CTCTTTCAGCCGGAACGAAACGGTCACGGTTAATACCCGTGACTACTGACGGTACCGGAA 480
Query: 563109 GAAGAAGCACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCGAGCGTTA 563168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 GAAGAAGCACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCGAGCGTTA 540
Query: 563169 ATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGTGCGCAGGCGGTTTTGTAAGTCAGATGTGAAATCCC 563228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 ATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGTGCGCAGGCGGTTTTGTAAGTCAGATGTGAAATCCC 600
Query: 563229 CGGGCTTAACCTGGGAACTGCGTTTGAAACTACAAGGCTAGAGTGTGGCAGAGGGGGGTG 563288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 CGGGCTTAACCTGGGAACTGCGTTTGAAACTACAAGGCTAGAGTGTGGCAGAGGGGGGTG 660
Query: 563289 GAATTCCACGTGTAGCAGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCA 563348
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 661 GAATTCCACGTGTAGCAGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGANCACCGATGGCGAAGGCA 720
Query: 563349 GCCCCCTGGGTTAACACTGACGCTCAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGAT 563408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 GCCCCCTGGGTTAACACTGACGCTCAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGAT 780
Query: 563409 ACCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGTCAACTAGTTGTCGGGTCTTAACGGACTTGGT 563468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 ACCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGTCAACTAGTTGTCGGGTCTTAACGGACTTGGT 840
Query: 563469 AACGCAGCTAACGCGTGAAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAA 563528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 AACGCAGCTAACGCGTGAAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAA 900
Query: 563529 AGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGATTATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGA 563588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 AGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGATTATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGA 960
Query: 563589 AAAACCTTACCTACCCTTGACATGTGCCGGAGCCCGCCGAGAGGTGGGTGTGCCCGAAAG 563648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 961 AAAACCTTACCTACCCTTGACATGTGCCGGAGCCCGCCGAGAGGTGGNTGTGCCCGAAAG 1020
Query: 563649 GGAACGGCAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTA 563708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 GGAACGGCAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTA 1080
Query: 563709 AGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCATTAATTGCCATCATTCAGTTGGGCACTTTAAT 563768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 AGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCATTAATTGCCATCATTCAGTTGGGCACTTTAAT 1140
Query: 563769 GAAACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTA 563828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 GAAACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTA 1200
Query: 563829 TGGGTAGGGCTTCACACGTAATACAATGGCGCGTACAGAGGGTTGCCAACCCGCGAGGGG 563888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 TGGGTAGGGCTTCACACGTAATACAATGGCGCGTACAGAGGGTTGCCAACCCGCGAGGGG 1260
Query: 563889 GAGCTAATCTCAGAAAGCGCGTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAA 563948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 GAGCTAATCTCAGAAAGCGCGTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAA 1320
Query: 563949 GTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGT 564008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1321 GTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGT 1380
Query: 564009 ACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTCCACCAGAAGCAGGTAGTCTAACCGCAA 564068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 ACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTCCACCAGAAGCAGGTAGTCTAACCGCAA 1440
Query: 564069 GGAGGGCGCCTGCCACGGTGAGATTCATGACTGGGGTG 564106
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 GGAGGGCGCCTGCNACGGTGAGATTCATGACTGGGGTG 1478
>Nitrosospira briensis L35505 (length=1458)
Length = 1458
Plus Strand HSPs:
Score = 7104 (1071.9 bits), Expect = 3.2e-312, P = 3.2e-312
Identities = 1436/1458 (98%), Positives = 1438/1458 (98%), Strand = Plus / Plus
Query: 562649 ATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATGCAAGTCGAACGGCAGCACGGGGGCAACCCT 562708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATGCAAGTCGAACGGCAGCACGGGGGCAACCCT 60
Query: 562709 GGTGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAATACATCGGAACGTATCCTTAAGTGGGGGATAAC 562768
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct: 61 GGTGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAATGCATCGGAACGTATCTTCAAGTGGGGGATAAC 120
Query: 562769 GCACCGAAAGGTGTGCTAATACCGCATAATCTCCGAGGAGAAAAGCAGGGGATCGCAAGA 562828
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 GCACCGAAAGGTGTGCTAATACCGCATAATCTCTACGGAGAAAAGCAGGGGATCGCAAGA 180
Query: 562829 CCTTGCGCTTTTGGAGCGGCCGATGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTTACCA 562888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 CCTTGCGCTTTTGGAGCGGCCGATGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTTACCA 240
Query: 562889 AGGCGTCGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGACGACCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGC 562948
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 AGGCTTCGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGACGACCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGC 300
Query: 562949 CCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGGGAAACCCTGATCCA 563008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 CCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGGGAAACCCTGATCCA 360
Query: 563009 GCCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCTCTTTCAGCCGGAACGAAA 563068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 GCCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCTCTTTCAGCCGGAACGAAA 420
Query: 563069 CGGTCACGGTTAATACCCGTGACTACTGACGGTACCGGAAGAAGAAGCACCGGCTAACTA 563128
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 CGGTCACGGTTAATACCCGTGATCACTGACGGTACCGGAAGAAGAAGCACCGGCTAACTA 480
Query: 563129 CGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAA 563188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 CGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAA 540
Query: 563189 AGCGTGCGCAGGCGGTTTTGTAAGTCAGATGTGAAATCCCCGGGCTTAACCTGGGAACTG 563248
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 541 AGCGTGCGCAGGCGGTTTTGTAAGTCAGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTG 600
Query: 563249 CGTTTGAAACTACAAGGCTAGAGTGTGGCAGAGGGGGGTGGAATTCCACGTGTAGCAGTG 563308
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 CGTTTGAAACTACAAGGCTAGAGTGTAGCAGAGGGGGGTGGAATTCCACGTGTAGCAGTG 660
Query: 563309 AAATGCGTAGAGATGTGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCAGCCCCCTGGGTTAACACTGA 563368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 AAATGCGTAGAGATGTGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCAGCCCCCTGGGTTAACACTGA 720
Query: 563369 CGCTCAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCT 563428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 CGCTCAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCT 780
Query: 563429 AAACGATGTCAACTAGTTGTCGGGTCTTAACGGACTTGGTAACGCAGCTAACGCGTGAAG 563488
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 AAACGATGTCAACTAGTTGTCGGGTCTTAACGGGCTTGGTAACGCAGCTAACGCGTGAAG 840
Query: 563489 TTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGC 563548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 TTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGC 900
Query: 563549 ACAAGCGGTGGATTATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAAAACCTTACCTACCCTTGA 563608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 ACAAGCGGTGGATTATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAAAACCTTACCTACCCTTGA 960
Query: 563609 CATGTGCCGGAGCCCGCCGAGAGGTGGGTGTGCCCGAAAGGGAACGGCAACACAGGTGCT 563668
||||| ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 961 CATGTACCGAAGTCCGCTGAGAGGTGGATGTGCCCGAAAGGGAACGGTAACACAGGTGCT 1020
Query: 563669 GCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAAC 563728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 GCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAAC 1080
Query: 563729 CCTTGTCATTAATTGCCATCATTCAGTTGGGCACTTTAATGAAACTGCCGGTGACAAACC 563788
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 1081 CCTTGTCATTAATTGCCATCATTCAGTTGGGCACTTTAATGAGACTGCCGGTGACAAACC 1140
Query: 563789 GGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGGGTAGGGCTTCACACGTA 563848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 GGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGGGTAGGGCTTCACACGTA 1200
Query: 563849 ATACAATGGCGCGTACAGAGGGTTGCCAACCCGCGAGGGGGAGCTAATCTCAGAAAGCGC 563908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 ATACAATGGCGCGTACAGAGGGTTGCCAACCCGCGAGGGGGAGCTAATCTCAGAAAGCGC 1260
Query: 563909 GTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCG 563968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 GTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCG 1320
Query: 563969 CGGATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCA 564028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1321 CGGATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCA 1380
Query: 564029 TGGGAGTGGGTTCCACCAGAAGCAGGTAGTCTAACCGCAAGGAGGGCGCCTGCCACGGTG 564088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||++ |||||||
Sbjct: 1381 TGGGAGTGGGTTCCACCAGAAGCAGGTAGTCTAACCGCAAGGAGGGCGCCKKNCACGGTG 1440
Query: 564089 AGATTCATGACTGGGGTG 564106
||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 AGATTCATGACTGGGGTG 1458
>Nitrosovibrio tenuis M96397 (length=1435)
Length = 1435
Plus Strand HSPs:
Score = 6941 (1047.5 bits), Expect = 7.5e-305, P = 7.5e-305
Identities = 1408/1436 (98%), Positives = 1409/1436 (98%), Strand = Plus / Plus
Query: 562630 GAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATGCAAGTCGAACG 562689
||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 GAGTTTGATGGTNGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATGCAAGTCGAACG 60
Query: 562690 GCAGCACGGGGGCAACCCTGGTGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAATACATCGGAACGTA 562749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 61 GCAGCACGGGGGCAACCCTGGTGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAATGCATCGGAACGTA 120
Query: 562750 TCCTTAAGTGGGGGATAACGCACCGAAAGGTGTGCTAATACCGCATAATCTCCGAGGAGA 562809
|| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 121 TCTTCGAGTGGGGGATAACGCACCGAAAGGTGTGCTAATACCGCATAATCTCTACGGAGA 180
Query: 562810 AAAGCAGGGGATCGCAAGACCTTGCGCTTTTGGAGCGGCCGATGTCTGATTAGCTAGTTG 562869
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 AAAGCAGGGGATCGCAAGACCTTGCGCTCTTGGAGCGGCCGATGTCTGATTAGCTAGTTG 240
Query: 562870 GTGAGGTAAAGGCTTACCAAGGCGTCGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGACGACCAGCCAC 562929
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 241 GTGAGGTAAAGGCTTACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGACGACCAGCCNC 300
Query: 562930 ACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAA 562989
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAA 360
Query: 562990 TGGGGGAAACCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGC 563049
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct: 361 TGGGGGAAACCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGCCTTTCGGGTTGTAAAGC 420
Query: 563050 TCTTTCAGCCGGAACGAAACGGTCACGGTTAATACCCGTGACTACTGACGGTACCGGAAG 563109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 TCTTTCAGCCGGAACGAAACGGTCACGGTTAATACCCGTGACTACTGACGGTACCGGAAG 480
Query: 563110 AAGAAGCACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCGAGCGTTAA 563169
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 AAGAAGCACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCGAGCGTTAA 540
Query: 563170 TCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGTGCGCAGGCGGTTTTGTAAGTCAGATGTGAAATCCCC 563229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 TCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGTGCGCAGGCGGTTTTGTAAGTCAGATGTGAAATCCCC 600
Query: 563230 GGGCTTAACCTGGGAACTGCGTTTGAAACTACAAGGCTAGAGTGTGGCAGAGGGGGGTGG 563289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 GGGCTTAACCTGGGAACTGCGTTTGAAACTACAAGGCTAGAGTGTGGCAGAGGGGGGTGG 660
Query: 563290 AATTCCACGTGTAGCAGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCAG 563349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 AATTCCACGTGTAGCAGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCAG 720
Query: 563350 CCCCCTGGGTTAACACTGACGCTCAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATA 563409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 CCCCCTGGGTTAACACTGACGCTCAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATA 780
Query: 563410 CCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGTCAACTAGTTGTCGGGTCTTAACGGACTTGGTA 563469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 CCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGTCAACTAGTTGTCGGGTCTTAACGGACTTGGTA 840
Query: 563470 ACGCAGCTAACGCGTGAAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAA 563529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 ACGCAGCTAACGCGTGAAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAA 900
Query: 563530 GGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGATTATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAA 563589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 GGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGATTATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAA 960
Query: 563590 AAACCTTACCTACCCTTGACATGTGCCGGAGCCCGCCGAGAGGTGGGTGTGCCCGAAAGG 563649
|||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 AAACCTTACCTACCCTTGACATGTACCGAAGCCCGCTGAGAGGTGGGTGTGCCCGAAAGG 1020
Query: 563650 GAACGGCAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAA 563709
| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 -AGCGGTAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAA 1079
Query: 563710 GTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCATTAATTGCCATCATTCAGTTGGGCACTTTAATG 563769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1080 GTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCATTAATTGCCATCATTCAGTTGGGCACTTTAATG 1139
Query: 563770 AAACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTAT 563829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1140 AAACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTAT 1199
Query: 563830 GGGTAGGGCTTCACACGTAATACAATGGCGCGTACAGAGGGTTGCCAACCCGCGAGGGGG 563889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1200 GGGTAGGGCTTCACACGTAATACAATGGCGCGTACAGAGGGTTGCCAACCCGCGAGGGGG 1259
Query: 563890 AGCTAATCTCAGAAAGCGCGTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAG 563949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1260 AGCTAATCTCAGAAAGCGCGTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAG 1319
Query: 563950 TCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTA 564009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1320 TCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTA 1379
Query: 564010 CACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTCCACCAGAAGCAGGTAGTCTAACCG 564065
||||||||||||+|| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct: 1380 CACACCGCCCGTYACNCCATGGGAGTGGGTTTNNCCAGAANNAGGTAGTCTAACCG 1435
>Nitrosospira sp. X90820 (length=1418)
Length = 1418
Plus Strand HSPs:
Score = 6928 (1045.5 bits), Expect = 2.9e-304, P = 2.9e-304
Identities = 1400/1418 (98%), Positives = 1400/1418 (98%), Strand = Plus / Plus
Query: 562657 CTGGCGGCATGCTTTACACATGCAAGTCGAACGGCAGCACGGGGGCAACCCTGGTGGCGA 562716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 CTGGCGGCATGCTTTACACATGCAAGTCGAACGGCAGCACGGGGGCAACCCTGGTGGCGA 60
Query: 562717 GTGGCGAACGGGTGAGTAATACATCGGAACGTATCCTTAAGTGGGGGATAACGCACCGAA 562776
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 61 GTGGCGAACGGGTGAGTAATGCATCGGAACGTATCCTTAAGTGGGGGATAACGCATCGAA 120
Query: 562777 AGGTGTGCTAATACCGCATAATCTCCGAGGAGAAAAGCAGGGGATCGCAAGACCTTGCGC 562836
|| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 AGATGCGCTAATACCGCATAATCTCTGAGGAGAAAAGCAGGGGATCGCAAGACCTTGCGC 180
Query: 562837 TTTTGGAGCGGCCGATGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTTACCAAGGCGTCG 562896
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 181 TTTTGGAGCGGCCGATGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTTACCAAGGCTTCG 240
Query: 562897 ATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGACGACCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTC 562956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGACGACCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTC 300
Query: 562957 CTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGGGAAACCCTGATCCAGCCATGCC 563016
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 CTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGGGCAACCCTGATCCAGCCATGCC 360
Query: 563017 GCGTGAGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCTCTTTCAGCCGGAACGAAACGGTCACG 563076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 GCGTGAGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCTCTTTCAGCCGGAACGAAACGGTCACG 420
Query: 563077 GTTAATACCCGTGACTACTGACGGTACCGGAAGAAGAAGCACCGGCTAACTACGTGCCAG 563136
||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 GTTAATAACTGTGATCACTGACGGTACCGGAAGAAGAAGCACCGGCTAACTACGTGCCAG 480
Query: 563137 CAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGTGCG 563196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 CAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGTGCG 540
Query: 563197 CAGGCGGTTTTGTAAGTCAGATGTGAAATCCCCGGGCTTAACCTGGGAACTGCGTTTGAA 563256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 CAGGCGGTTTTGTAAGTCAGATGTGAAATCCCCGGGCTTAACCTGGGAACTGCGTTTGAA 600
Query: 563257 ACTACAAGGCTAGAGTGTGGCAGAGGGGGGTGGAATTCCACGTGTAGCAGTGAAATGCGT 563316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 ACTACAAGGCTAGAGTGTGGCAGAGGGGGGTGGAATTCCACGTGTAGCAGTGAAATGCGT 660
Query: 563317 AGAGATGTGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCAGCCCCCTGGGTTAACACTGACGCTCAGG 563376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 AGAGATGTGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCAGCCCCCTGGGTTAACACTGACGCTCAGG 720
Query: 563377 CACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATG 563436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 CACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATG 780
Query: 563437 TCAACTAGTTGTCGGGTCTTAACGGACTTGGTAACGCAGCTAACGCGTGAAGTTGACCGC 563496
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 TCAACTAGTTGTCGGGCCTTAACGGGCTTGGTAACGCAGCTAACGCGTGAAGTTGACCGC 840
Query: 563497 CTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGG 563556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 CTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGG 900
Query: 563557 TGGATTATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAAAACCTTACCTACCCTTGACATGTGCC 563616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 901 TGGATTATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAAAACCTTACCTACCCTTGACATGTACC 960
Query: 563617 GGAGCCCGCCGAGAGGTGGGTGTGCCCGAAAGGGAACGGCAACACAGGTGCTGCATGGCT 563676
| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 GAAGCCCGCCGAGAAGTGGGTGTGCCCGAAAGGGAACGGTAACACAGGTGCTGCATGGCT 1020
Query: 563677 GTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCA 563736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 GTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCA 1080
Query: 563737 TTAATTGCCATCATTCAGTTGGGCACTTTAATGAAACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAG 563796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 TTAATTGCCATCATTCAGTTGGGCACTTTAATGAAACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAG 1140
Query: 563797 GTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGGGTAGGGCTTCACACGTAATACAATG 563856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 GTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGGGTAGGGCTTCACACGTAATACAATG 1200
Query: 563857 GCGCGTACAGAGGGTTGCCAACCCGCGAGGGGGAGCTAATCTCAGAAAGCGCGTCGTAGT 563916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 GCGCGTACAGAGGGTTGCCAACCCGCGAGGGGGAGCTAATCTCAGAAAGCGCGTCGTAGT 1260
Query: 563917 CCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAG 563976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 CCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAG 1320
Query: 563977 CATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTG 564036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1321 CATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTG 1380
Query: 564037 GGTTCCACCAGAAGCAGGTAGTCTAACCGCAAGGAGGG 564074
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 GGTTTCACCAGAAGCAGGTAGTCTAACCGCAAGGAGGG 1418
>Nitrosovibrio tenuis M96405 (length=1434)
Length = 1434
Plus Strand HSPs:
Score = 6921 (1044.5 bits), Expect = 6.0e-304, P = 6.0e-304
Identities = 1408/1436 (98%), Positives = 1409/1436 (98%), Strand = Plus / Plus
Query: 562635 TGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATGCAAGTCGAACGGCAGC 562694
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 TGATCCTNGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATGCAAGTCGAACGGCAGC 60
Query: 562695 ACGGGGGCAACCCTGGTGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAATACATCGGAACGTATCCTT 562754
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct: 61 ACGGGGGCAACCCTGGTGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAATGCATCGGAACGTATCTTC 120
Query: 562755 AAGTGGGGGATAACGCACCGAAAGGTGTGCTAATACCGCATAATCTCCGAGGAGAAAAGC 562814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 121 AAGTGGGGGATAACGCACCGAAAGGTGTGCTAATACCGCATAATCTCTACGGAGAAAAGC 180
Query: 562815 AGGGGATCGCAAGACCTTGCGCTTTTGGAGCGGCCGATGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAG 562874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 AGGGGATCGCAAGACCTTGCGCTTTTGGAGCGGCCGATGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAG 240
Query: 562875 GTAAAGGCTTACCAAGGCGTCGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGACGACCAGCCACACTGG 562934
||||||||||||||+|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 GTAAAGGCTTACCAWGGCGTCGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGACGACCAGCCACACTGG 300
Query: 562935 GACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGG 562994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 GACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGG 360
Query: 562995 GAAACCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCTCTTT 563054
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 GAAACCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCTCTTT 420
Query: 563055 CAGCCGGAACGAAACGGTCACGGTTAATACCCGTGACTACTGACGGTACCGGAAGAAGAA 563114
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 CAGCCGGAACGAAACGGTCACGGTTAATACCTGTGATCACTGACGGTACCGGAAGAAGAA 480
Query: 563115 GCACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCGAGCGTTAATCGGA 563174
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 481 GCACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCAAGCGTTAATCGGA 540
Query: 563175 ATTACTGGGCGTAAAGCGTGCGCAGGCGGTTTTGTAAGTCAGATGTGAAATCCCCGGGCT 563234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 ATTACTGGGCGTAAAGCGTGCGCAGGCGGTTTTGTAAGTCAGATGTGAAATCCCCGGGCT 600
Query: 563235 TAACCTGGGAACTGCGTTTGAAACTACAAGGCTAGAGTGTGGCAGAGGGGGGTGGAATTC 563294
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 601 TAACCTGGGAACTGCGTTTGAAAGTACAAGGCTAGAGTGTAGCAGAGGGGGGTGGAATTC 660
Query: 563295 CACGTGTAGCAGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCAGCCCCC 563354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 CACGTGTAGCAGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCAGCCCCC 720
Query: 563355 TGGGTTAACACTGACGCTCAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTG 563414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 TGGGTTAACACTGACGCTCAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTG 780
Query: 563415 GTAGTCCACGCCCTAAACGATGTCAACTAGTTGTCGGGTCTTAACGGACTTGGTAACGC- 563473
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||
Sbjct: 781 GTAGTCCACGCCCTAAACTATGTCAACTAGTTGTCGGGNCTTAACGGGCTTGGTAA-GCG 839
Query: 563474 AGCTAACGCGTGAAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAA 563533
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840 AGCTAACGCGTGAAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAA 899
Query: 563534 TTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGATTATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAAAAC 563593
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 900 TTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGATTATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAAAAC 959
Query: 563594 CTTACCTACCCTTGACATGTGCCGGAGCCCGCCGAGAGGTGGGTGTGCCCGAAAGGGAAC 563653
|||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 960 CTTACCTACCCTTGACATGTACCGAAGCCCGCCGAGAGGTGGGTGTGCCCGAAAGG-AAC 1018
Query: 563654 GGCAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCC 563713
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1019 GGTAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCC 1078
Query: 563714 CGCAACGAGCGCAACCCTTGTCATTAATTGCCATCATTCAGTTGGGCACTTTAATGAAAC 563773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1079 CGCAACGAGCGCAACCCTTGTCATTAATTGCCATCATTCAGTTGGGCACTTTAATGAAAC 1138
Query: 563774 TGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGGGT 563833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1139 TGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGGGT 1198
Query: 563834 AGGGCTTCACACGTAATACAATGGCGCGTACAGAGGGTTGCCAACCCGCGAGGGGGAGCT 563893
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1199 AGGGCTTCACACGTAATACAATGGCGCGTACAGAGGGTTGCCAACCCGCGAGGGGGAGCC 1258
Query: 563894 AATCTCAGAAAGCGCGTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGG 563953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1259 AATCTCAGAAAGCGCGTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGG 1318
Query: 563954 AATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACA 564013
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1319 TTTCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACA 1378
Query: 564014 CCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTCCACCAGAAGCAGGTAGTCTAACCGCAAG 564069
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 1379 CCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTTCACCAGAAGNAGGTAGTCTAACCGCAAG 1434
>Nitrosospira briensis M96396 (length=1448)
Length = 1448
Plus Strand HSPs:
Score = 6918 (1044.0 bits), Expect = 8.1e-304, P = 8.1e-304
Identities = 1414/1450 (97%), Positives = 1414/1450 (97%), Strand = Plus / Plus
Query: 562632 GTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATGCAAGTCGAACGGC 562691
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 GTTTGATCCTNGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATGCAAGTCGAACGGC 60
Query: 562692 AGCACGGGGGCAACCCTGGTGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAATACATCGGAACGTATC 562751
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 61 AGCACGGGGGCAACCCTGGTGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAATGCATCGGAACGTATC 120
Query: 562752 CTTAAGTGGGGGATAACGCACCGAAAGGTGTGCTAATACCGCATAATCTCCGAGGAGAAA 562811
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 121 TTCAAGTGGGGGATAACGCACCGAAAGGTGTGCTAATACCGCATAATCTCTACGGAGAAA 180
Query: 562812 AGCAGGGGATCGCAAGACCTTGCGCTTTTGGAGCGGCCGATGTCTGATTAGCTAGTTGGT 562871
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 AGCAGGGGATCGCAAGACCTTGCGCTTTTGGAGCGGCCGATGTCTGATTAGCTAGTTGGT 240
Query: 562872 GAGGTAAAGGCTTACCAAGGCGTCGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGACGACCAGCCACAC 562931
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 GAGGTAAAGGCTTACCAAGGCTTCGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGACGACCAGCCACAC 300
Query: 562932 TGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATG 562991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 TGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATG 360
Query: 562992 GGGGAAACCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCTC 563051
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 GGGGAAACCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCTC 420
Query: 563052 TTTCAGCCGGAACGAAACGGTCACGGTTAATACCCGTGACTACTGACGGTACCGGAAGAA 563111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 421 TTTCAGCCGGAACGAAACGGTCACGGTTAATACCCGTGATCACTGACGGTACCGGAAGAA 480
Query: 563112 GAAGCACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCGAGCGTTAATC 563171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 GAAGCACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCGAGCGTTAATC 540
Query: 563172 GGAATTACTGGGCGTAAAGCGTGCGCAGGCGGTTTTGTAAGTCAGATGTGAAATCCCCGG 563231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 GGAATTACTGGGCGTAAAGCGTGCGCAGGCGGTTTTGTAAGTCAGATGTGAAATCCCCGG 600
Query: 563232 GCTTAACCTGGGAACTGCGTTTGAAACTACAAGGCTAGAGTGTGGCAGAGGGGGGTGGAA 563291
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 601 GCTCAACCTGGGAACTGCGTTTGAAACTACAAGGCTAGAGTGTAGCAGAGGGGGGTGGAA 660
Query: 563292 TTCCACGTGTAGCAGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCAGCC 563351
|||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 TTCCACGTGTAGCAGTGAAATGCGTAGATATGCGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCAGCT 720
Query: 563352 CCCTGGGTTAACACTGACGCTCAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACC 563411
||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 CCCTGGGCTAACACTGACGCTCATGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACC 780
Query: 563412 CTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGTCAACTAGTTGTCGGGTCTTAACGGACTTGGTAAC 563471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct: 781 CTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGTCAACTAGTTGTCGGGNCTTAACGGGCTTGGTAAC 840
Query: 563472 GCAGCTAACGCGTGAAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGG 563531
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||
Sbjct: 841 GTAGCTAACGCGTGAAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGATCGCAACATTAAAACTCAAAGG 900
Query: 563532 AATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGATTATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAAA 563591
||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 901 AATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGATTATCTCCATTAATTGCATGCAACGCGAAAA 960
Query: 563592 ACCTTACCTACCCTTGACATGTGCCGGAGCCCGCCGAGAGGTGGGTGTGCCCGAAAGGGA 563651
|||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| |
Sbjct: 961 ACCTTACCTACCCTTGACATGTACCGAAGTCCGCTGAGAGGTGGATGTGCCCGAAAGG-A 1019
Query: 563652 ACGGCAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGT 563711
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1020 ACGGTAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGT 1079
Query: 563712 CCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCATTAATTGCCATCATTCAGTTGGGCACTTTAATGAA 563771
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1080 CCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCATTAATTGCCATCATTCAGTTGGGCACTTTAATGAG 1139
Query: 563772 ACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGG 563831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1140 ACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGG 1199
Query: 563832 GTAGGGCTTCACACGTAATACAATGGCGCGTACAGAGGGTTGCCAACCCGCGAGGGGGAG 563891
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1200 GTAGGGCTTCACACGTAATACAATGGCGCGTACAGAGGGTTGCCAACCCGCGAGGGGGAG 1259
Query: 563892 CTAATCTCAGAAAGCGCGTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTC 563951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1260 CTAATCTCAGAAAGCGCGTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTC 1319
Query: 563952 GGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACA 564011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1320 GGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACA 1379
Query: 564012 CACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTCCACCAGAAGCAGGTAGTCTAACCGCAAGGA 564071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1380 CACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTCCACCAGAAGCAGGTAGTCTAACCGCAAGGA 1439
Query: 564072 GGGCGCCTGC 564081
|| |||||||
Sbjct: 1440 GG-CGCCTGC 1448
>Nitrosovibrio sp. AF080256 (length=1447)
Length = 1447
Plus Strand HSPs:
Score = 6876 (1037.7 bits), Expect = 6.4e-302, P = 6.4e-302
Identities = 1416/1455 (97%), Positives = 1416/1455 (97%), Strand = Plus / Plus
Query: 562650 TTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATGCAAGTCGAACGGCAGCACGGGGGCAACCCTG 562709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 TTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATGCAAGTCGAACGGCAGCACGGGGGCAACCCTG 60
Query: 562710 GTGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAATACATCGGAACGTATCCTTAAGTGGGGGATAACG 562769
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct: 61 GTGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAATGCATCGGAACGTATCTTCAAGTGGGGGATAACG 120
Query: 562770 CACCGAAAGGTGTGCTAATACCGCATAATCTCCGAGGAGAAAAGCAGGGGATCGCAAGAC 562829
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 CACCGAAAGGTGTGCTAATACCGCATAATCTCTACGGAGAAAAGCAGGGGATCGCAAGAC 180
Query: 562830 CTTGCGCTTTTGGAGCGGCCGATGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTTACCAA 562889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 CTTGCGCTTTTGGAGCGGCCGATGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTTACCAA 240
Query: 562890 GGCGTCGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGACGACCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCC 562949
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 GGCTTCGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGACAACCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCC 300
Query: 562950 CAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGGGAAACCCTGATCCAG 563009
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 CAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGGGAAACCCTGATCCAG 360
Query: 563010 CCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCTCTTTCAGCCGGAACGAAAC 563069
|||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 CCATGCCGCGTGAGTGAAAAAG-CCTTCGGGTTGTAAAGCTCTTTCAGCCGGAACGAAAC 419
Query: 563070 GGTCACGGTTAATACCCGTGACTACTGACGGTACCGGAAGAAGAAGCACCGGCTAACTAC 563129
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct: 420 GGTCACGGTTAATACCCGTGATCACTGACGGTACCGGAAGAAAAAACACCGGCTAACTAC 479
Query: 563130 GTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAA 563189
|||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 TTGCCAGCA-CCGCGGTAATACTTAGGGTGCGA-CGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAA 537
Query: 563190 GCGTGCGCAGGCGGTTTTGTAAGTCAGATGTGAAATCCCCGGGCTTAACCTGGGAACTGC 563249
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||
Sbjct: 538 -CGTGCGCAGGCGGTTTTGTAAGTCAGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAA-TGC 595
Query: 563250 GTTTGAAACTACAAGGCTAGAGTGTGGCAGAGGGGGGTGGAATTCCACGTGTAGCAGTGA 563309
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 596 GTTTGAAACTACAAGGCTAGAGTGTAGCAGAGGGGGGTGGAATTCCAAGTGTAGCAGTGA 655
Query: 563310 AATGCGTAGAGATGTGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCAGCCCCCTGGGTTAACACTGAC 563369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 656 AATGCGTAGAGATGTGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCAGCCCCCTGGGTTAACACTGAC 715
Query: 563370 GCTCAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCTA 563429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 716 GCTCAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCTA 775
Query: 563430 AACGATGTCAACTAGTTGTCGGGTCTTAACGGACTTGGTAACGCAGCTAACGCGTGAAGT 563489
||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 776 AACGATGTCAAATAGTTGTCGGGTTTTAACGGGCTTGGTAACGCAGCTAAAGCGTGAAGT 835
Query: 563490 TGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCA 563549
||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||
Sbjct: 836 TGACCGCCTGGGGAGTACGGTTGCAAGATTAAAA-TCAAAG-AATTGACGGG-ACCCGCA 892
Query: 563550 CAAGCGGTGGATTATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAAAACCTTACCTACCCTTGAC 563609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 893 CAAGCGGTGGATTATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAAAACCTTACCTACCCTTGAC 952
Query: 563610 ATGTGCCGGAGCCCGCCGAGAGGTGGGTGTGCCCGAAAGGGAACGGCAACACAGGTGCTG 563669
|||| ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 953 ATGTACCGAAGTCCGCTGAGAGGTGGATGTGCCCGAAAGGGAACGGTAACACAGGTGCTG 1012
Query: 563670 CATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACC 563729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1013 CATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACC 1072
Query: 563730 CTTGTCATTAATTGCCATCATTCAGTTGGGCACTTTAATGAAACTGCCGGTGACAAACCG 563789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 1073 CTTGTCATTAATTGCCATCATTCAGTTGGGCACTTTAATGAGACTGCCGGTGACAAACCG 1132
Query: 563790 GAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGGGTAGGGCTTCACACGTAA 563849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1133 GAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGGGTAGGGCTTCACACGTAA 1192
Query: 563850 TACAATGGCGCGTACAGAGGGTTGCCAACCCGCGAGGGGGAGCTAATCTCAGAAAGCGCG 563909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1193 TACAATGGCGCGTACAGAGGGTTGCCAACCCGCGAGGGGGAGCTAATCTCAGAAAGCGCG 1252
Query: 563910 TCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGC 563969
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1253 TCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGC 1312
Query: 563970 GGATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCAT 564029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1313 GGATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCAT 1372
Query: 564030 GGGAGTGGGTTCCACCAGAAGCAGGTAGTCTAACCGCAAGGAGGGCGCCTGCCACGGTGA 564089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1373 GGGAGTGGGTTCCACCAGAAGCAGGTAGTCTAACCGCAAGGAGGGCGCCTGCCACGGTGA 1432
Query: 564090 GATTCATGACTGGGG 564104
|||||||||||||||
Sbjct: 1433 GATTCATGACTGGGG 1447
>Nitrosospira sp. AJ000344 (length=1400)
Length = 1400
Plus Strand HSPs:
Score = 6718 (1014.0 bits), Expect = 9.1e-295, P = 9.1e-295
Identities = 1376/1405 (97%), Positives = 1376/1405 (97%), Strand = Plus / Plus
Query: 562675 CATGCAAGTCGAACGGCAGCACGGGGGCAACCCTGGTGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTA 562734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 CATGCAAGTCGAACGGCAGCACGGGGGCAACCCTGGTGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTA 60
Query: 562735 ATACATCGGAACGTATCCTTAAGTGGGGGATAACGCACCGAAAGGTGTGCTAATACCGCA 562794
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
Sbjct: 61 ATGCATCGGAACGTATCCTTAAGTGGGGGATAACGCATCGAAAGATGCGCTAATACCG-A 119
Query: 562795 TAATCTCCGAGGAGAAAAGCAGGGGATCGCAAGACCTTGCGCTTTTGGAGCGGCCGATGT 562854
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 120 TAATCTCTGAGGAGAAAAGCAGGGGATCGCAAGACCTTGCGCTTTTGGAGCGGCCGATGT 179
Query: 562855 CTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTTACCAAGGCGTCGATCAGTAGCTGGTCTGAG 562914
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 180 CTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTTACCAAGGCTTCGATCAGTAGCTGGTCTGAG 239
Query: 562915 AGGACGACCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCA-GACTCCTACGGGA-GGCAGCAG 562972
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 240 AGGACGACCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAAGACTCCTACGGGAAGGCAGCAG 299
Query: 562973 TGGGGAATTTTGGACAATGGGGGAAACCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGG 563032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 300 TGGGGAATTTTGGACAATGGGGGAAACCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGG 359
Query: 563033 CCTTCGGGTTGTAAAGCTCTTTCAGCCGGAACGAAACGGTCACGGTTAATACCCGTGACT 563092
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 360 CCTTCGGGTTGTAAAGCTCTTTCAGCCGGAACGAAAAGGTTACGGTTAATACCCGTGACT 419
Query: 563093 ACTGACGGTACCGGAAGAAGAAGCACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACG 563152
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 420 AATGACGGTACCGGAAGAAGAAGCACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACG 479
Query: 563153 TAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGTGCGCAGGCGGTTTTGTAAG 563212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 TAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGTGCGCAGGCGGTTTTGTAAG 539
Query: 563213 TCAGATGTGAAATCCCCGGGCTTAACCTGGGAACTGCGTTTGAAACTACAAGGCTAGAGT 563272
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 540 TCAGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCGTTTGAAACTACAAGGCTAGAGT 599
Query: 563273 GTGGCAGAGGGGGGTGGAATTCCACGTGTAGCAGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAAC 563332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 GTGGCAGAGGGGGGTGGAATTCCACGTGTAGCAGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAAC 659
Query: 563333 ACCGATGGCGAAGGCAGCCCCCTGGGTTAACACTGACGCTCAGGCACGAAAGCGTGGGGA 563392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660 ACCGATGGCGAAGGCAGCCCCCTGGGTTAACACTGACGCTCAGGCACGAAAGCGTGGGGA 719
Query: 563393 GCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGTCAACTAGTTGTCGGG 563452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 GCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGTCAACTAGTTGTCGGG 779
Query: 563453 TCTTAACGGACTTGGTAACGCAGCTAACGCGTGAAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCG 563512
|||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 TCTTAACGGACTTGGTAACGTACGTAACGCGTGAAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCG 839
Query: 563513 CAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGATTATGTGGATTA 563572
|||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 840 CAAG-TTAAA-CTCAAAGGAATTGACGGGGACC-G-ACAAGCGGTGG-TTATGTGGATTA 894
Query: 563573 ATTCGATGCAACGCGAAAAACCTTACCTACCCTTGACATGTGCCGGAGCCCGCCGAGAGG 563632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||
Sbjct: 895 ATTCGATGCAACGCGAAAAACCTTACCTACCCTTGACATGTACCGAAGTCCGCTGAGAGG 954
Query: 563633 TGGGTGTGCCCGAAAGGGAACGGCAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTC 563692
||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 955 TGGATGTGCCCGAAAGGGAACGGTAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTC 1014
Query: 563693 GTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCATTAATTGCCATCATTC 563752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1015 GTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCATTAATTGCCATCATTC 1074
Query: 563753 AGTTGGGCACTTTAATGAAACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAA 563812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1075 AGTTGGGCACTTTAATGAAACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAA 1134
Query: 563813 GTCCTCATGGCCCTTATGGGTAGGGCTTCACACGTAATACAATGGCGCGTACAGAGGGTT 563872
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1135 GTCCTCATGGCCCTTATGGGTAGGGCTTCACACGTAATACAATGGCGCGTACAGAGGGTT 1194
Query: 563873 GCCAACCCGCGAGGGGGAGCTAATCTCAGAAAGCGCGTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGC 563932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1195 GCCAACCCGCGAGGGGGAGCTAATCTCAGAAAGCGCGTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGC 1254
Query: 563933 AACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGTCGCGGTGAATA 563992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1255 AACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGTCGCGGTGAATA 1314
Query: 563993 CGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTCCACCAGAAGCA 564052
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 1315 CGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTTCACCAGAAGCA 1374
Query: 564053 GGTAGTCTAACCGCAAGGAGGGCGC 564077
||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 1375 GGTAGTCTAACCGNAAGGAGGGCGC 1399
>Nitrosospira sp. AJ000345 (length=1401)
Length = 1401
Plus Strand HSPs:
Score = 6711 (1013.0 bits), Expect = 1.9e-294, P = 1.9e-294
Identities = 1373/1403 (97%), Positives = 1373/1403 (97%), Strand = Plus / Plus
Query: 562675 CATGCAAGTCGAACGGCAGCACGGGGGCAACCCTGGTGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTA 562734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 CATGCAAGTCGAACGGCAGCACGGGGGCAACCCTGGTGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTA 60
Query: 562735 ATACATCGGAACGTATCCTTAAGTGGGGGATAACGCACCGAAAGGTGTGCTAATACCGCA 562794
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
Sbjct: 61 ATGCATCGGAACGTATCCTTAAGTGGGGGATAACGCATCGAAAGATGCGCTAATACCG-A 119
Query: 562795 TAATCTCCGAGGAGAAAAGCAGGGGATCGCAAGACCTTGCGCTTTTGGAGCGGCCGATGT 562854
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 120 TAATCTCTGAGGAGAAAAGCAGGGGATCGCAAGACCTTGCGCTTTTGGAGCGGCCGATGT 179
Query: 562855 CTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTTACCAAGGCGTCGATCAGTAGCTGGTCTGAG 562914
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 180 CTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTTACCAAGGCTTCGATCAGTAGCTGGTCTGAG 239
Query: 562915 AGGACGACCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTG 562974
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 240 AGGACGACCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTG 299
Query: 562975 GGGAATTTTGGACAATGGGGGAAACCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCC 563034
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 300 GGGAATTTTGGACAATGGGGGCAACCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCC 359
Query: 563035 TTCGGGTTGTAAAGCTCTTTCAGCCGGAACGAAACGGTCACGGTTAATACCCGTGACTAC 563094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||
Sbjct: 360 TTCGGGTTGTAAAGCTCTTTCAGCCGGAACGAAACGGTCACGGTTAATAACTGTGATCAC 419
Query: 563095 TGACGGTACCGGAAGAAGAAGCACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTA 563154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 420 TGACGGTACCGGAAGAAGAAGCACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTA 479
Query: 563155 GGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGTGCGCAGGCGGTTTTGTAAGTC 563214
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 GCGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGTGCGCAGGCGGTTTTGTAAGTC 539
Query: 563215 AGATGTGAAATCCCCGGGCTTAACCTGGGAACTGCGTTTGAAACTACAAGGCTAGAGTGT 563274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 540 AGATGTGAAATCCCCGGGCTTAACCTGGGAACTGCGTTTGAAACTACAAGGCTAGAGTGT 599
Query: 563275 GGCAGAGGGGGGTGGAATTCCACGTGTAGCAGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAACAC 563334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 GGCAGAGGGGGGTGGAATTCCACGTGTAGCAGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAACAC 659
Query: 563335 CGATGGCGAAGGCAGCCCCCTGGGTTAACACTGACGCTCAGGCACGAAAGCGTGGGGAGC 563394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660 CGATGGCGAAGGCAGCCCCCTGGGTTAACACTGACGCTCAGGCACGAAAGCGTGGGGAGC 719
Query: 563395 AAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGTCAACTAGTTGTCGGGTC 563454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 AAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGTCAACTAGTTGTCGGGTC 779
Query: 563455 TTAACGGACTTGGTAACGCAGCTAACGCGTGAAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCA 563514
||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 TTAACGGGCTTGGTAACGCACGTAACGCGTGAAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCA 839
Query: 563515 AGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTGGATTATGTGGATTAAT 563574
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 840 AGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACC-GCACAAGCGGTGGATTATGTGGATTAAT 898
Query: 563575 TCGATGCAACGCGAAAAACCTTACCTACCCTTGACATGTGCCGGAGCCCGCCGAGAGGTG 563634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||
Sbjct: 899 TCGATGCAACGCGAAAAACCTTACCTACCCTTGACATGTACCGAAGCCCGCCGAGAAGTG 958
Query: 563635 GGTGTGCCCGAAAGGGAACGGCAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGT 563694
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 959 GGTGTGCCCGAAAGGGAACGGTAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGT 1018
Query: 563695 GAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCATTAATTGCCATCATTCAG 563754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 1019 GAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCATTAATTGCCATCATTTAG 1078
Query: 563755 TTGGGCACTTTAATGAAACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGT 563814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1079 TTGGGCACTTTAATGAAACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGT 1138
Query: 563815 CCTCATGGCCCTTATGGGTAGGGCTTCACACGTAATACAATGGCGCGTACAGAGGGTTGC 563874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1139 CCTCATGGCCCTTATGGGTAGGGCTTCACACGTAATACAATGGCGCGTACAGAGGGTTGC 1198
Query: 563875 CAACCCGCGAGGGGGAGCTAATCTCAGAAAGCGCGTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAA 563934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1199 CAACCCGCGAGGGGGAGCTAATCTCAGAAAGCGCGTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAA 1258
Query: 563935 CTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGTCGCGGTGAATACG 563994
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1259 CTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCNTGTAATCGCGGATCAGCATGTCGCGGTGAATACG 1318
Query: 563995 TTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTCCACCAGAAGCAG- 564053
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 1319 TTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTTCACCAGAAGCAGA 1378
Query: 564054 GTAGTCTAAC-CGCA-AG-GAGG 564073
|||||||||| || | || ||||
Sbjct: 1379 GTAGTCTAACACGAAGAGAGAGG 1401
>Nitrosovibrio tenuis M96404 (length=1378)
Length = 1378
Plus Strand HSPs:
Score = 6670 (1006.8 bits), Expect = 1.4e-292, P = 1.4e-292
Identities = 1354/1379 (98%), Positives = 1354/1379 (98%), Strand = Plus / Plus
Query: 562641 TGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATGCAAGTCGAACGGCAGCACGGGG 562700
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 TNGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATGCAAGTCGAACGGCAGCACGGGG 60
Query: 562701 GCAACCCTGGTGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAATACATCGGAACGTATCCTTAAGTGG 562760
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||
Sbjct: 61 GCAACCCTGGTGGCGAGTGGCGAACGGGTGAGTAATGCATCGGAACGTATCTTCGAGTGG 120
Query: 562761 GGGATAACGCACCGAAAGGTGTGCTAATACCGCATAATCTCCGAGGAGAAAAGCAGGGGA 562820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 121 GGGATAACGCACCGAAAGGTGTGCTAATACCGCATAATCTCTACGGAGAAAAGCAGGGGA 180
Query: 562821 TCGCAAGACCTTGCGCTTTTGGAGCGGCCGATGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAG 562880
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 TCGCAAGACCTTGCGCTCTTAGAGCGGCCGATGCCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAG 240
Query: 562881 GCTTACCAAGGCGTCGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGACGACCAGCCACACTGGGACTGA 562940
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 241 GCTTACCAAGGCGACGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGACGACCAGCCNNACTGGGACTGA 300
Query: 562941 GACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGGGAAACC 563000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 GACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGGGAAACC 360
Query: 563001 CTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCTCTTTCAGCCG 563060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 CTGATCCAGCCATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGCTCTTTCAGCCG 420
Query: 563061 GAACGAAACGGTCACGGTTAATACCCGTGACTACTGACGGTACCGGAAGAAGAAGCACCG 563120
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 GAACGAAACGGTCACGGCTAATACCCGTGACTACTGACGGTACCGGAAGAAGAAGCACCG 480
Query: 563121 GCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACT 563180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 481 GCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACT 540
Query: 563181 GGGCGTAAAGCGTGCGCAGGCGGTTTTGTAAGTCAGATGTGAAATCCCCGGGCTTAACCT 563240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 GGGCGTAAAGCGTGCGCAGGCGGTTTTGTAAGTCAGATGTGAAATCCCCGGGCTTAACCT 600
Query: 563241 GGGAACTGCGTTTGAAACTACAAGGCTAGAGTGTGGCAGAGGGGGGTGGAATTCCACGTG 563300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 GGGAACTGCGTTTGAAACTACAAGGCTAGAGTGTGGCAGAGGGGGGTGGAATTCCACGTG 660
Query: 563301 TAGCAGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCAGCCCCCTGGGTT 563360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 TAGCAGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCAGCCCCCTGGGTT 720
Query: 563361 AACACTGACGCTCAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTC 563420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 AACACTGACGCTCAGGCACGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTC 780
Query: 563421 CACGCCCTAAACGATGTCAACTAGTTGTCGGGTCTTAACGGACTTGGTAACGCAGCTAAC 563480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 CACGCCCTAAACGATGTCAACTAGTTGTCGGGTCTTAACGGACTTGGTAACGCAGCTAAC 840
Query: 563481 GCGTGAAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGG 563540
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 GCGTGAACTTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGG 900
Query: 563541 GGACCCGCACAAGCGGTGGATTATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAAAACCTTACCT 563600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 GGACCCGCACAAGCGGTGGATTATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAAAACCTTACCT 960
Query: 563601 ACCCTTGACATGTGCCGGAGCCCGCCGAGAGGTGGGTGTGCCCGAAAGGGAACGGCAACA 563660
||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||| ||||
Sbjct: 961 ACCCTTGACATGTACCGAAGCCCGCTGAGAGGTGGGCGTGCCCGAAAGG-AGCGGTAACA 1019
Query: 563661 CAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACG 563720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1020 CAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACG 1079
Query: 563721 AGCGCAACCCTTGTCATTAATTGCCATCATTCAGTTGGGCACTTTAATGAAACTGCCGGT 563780
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 1080 AGCGCAACCCTTGTCATTAATTGCCATCATTCAGTTGGGCACTTTAATGAGACTGCCGGT 1139
Query: 563781 GACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGGGTAGGGCTT 563840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1140 GACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGGGTAGGGCTT 1199
Query: 563841 CACACGTAATACAATGGCGCGTACAGAGGGTTGCCAACCCGCGAGGGGGAGCTAATCTCA 563900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1200 CACACGTAATACAATGGCGCGTACAGAGGGTTGCCAACCCGCGAGGGGGAGCTAATCTCA 1259
Query: 563901 GAAAGCGCGTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCT 563960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1260 GAAAGCGCGTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCT 1319
Query: 563961 AGTAATCGCGGATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCC 564019
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1320 AGTAATCGCGGATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCC 1378
WARNING: HSPs involving 12,237 database sequences were not reported due to
the limiting value of parameter B = 10.
Parameters:
E=1e-10
E2=1e-10
B=10
V=10
ucdb
ctxfactor=2.00
Query ----- As Used ----- ----- Computed ----
Strand MatID Matrix name Lambda K H Lambda K H
+1 0 +5,-4 0.192 0.182 0.357 same same same
Q=10,R=10 0.104 0.0151 0.0600 n/a n/a n/a
-1 0 +5,-4 0.192 0.182 0.357 same same same
Q=10,R=10 0.104 0.0151 0.0600 n/a n/a n/a
Query
Strand MatID Length Eff.Length E S W T X E2 S2
+1 0 3,184,243 3,184,243 9.3e-11 493 11 n/a 73 1.0e-10 186
171 0.047 124
-1 0 3,184,243 3,184,243 9.3e-11 493 11 n/a 73 1.0e-10 186
171 0.047 124
Statistics:
Database: /auto/database/rrna/16S.fasta
Title: 16S.fasta
Posted: 5:13:55 PM EST Dec 15, 2004
Created: 5:13:54 PM EST Dec 15, 2004
Format: XDF-1
# of letters in database: 17,852,017
# of sequences in database: 12,250
# of database sequences satisfying E: 12,247
No. of states in DFA: 1,311,187 (92,193 KB)
Total size of DFA: 138,585 KB (139,860 KB)
Time to generate neighborhood: 13.80u 0.46s 14.26t Elapsed: 00:00:14
No. of threads or processors used: 2
Search cpu time: 25.80u 0.10s 25.90t Elapsed: 00:00:52
Total cpu time: 39.66u 0.59s 40.25t Elapsed: 00:01:06
Start: Mon May 2 10:58:37 2005 End: Mon May 2 10:59:43 2005
WARNINGS ISSUED: 3
SiteMap
Feedback
Life Sciences Division
ORNL
Disclaimer
Webmaster
![[space]](http://homer.ornl.gov/compbio/public/images/bluespacer.gif){kind=small}
![[space]](http://maple.lsd.ornl.gov/common/images/bluespacer.gif){kind=small}